More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0015 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  100 
 
 
589 aa  1214  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.93 
 
 
561 aa  401  1e-110  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.59056e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.88 
 
 
559 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.71 
 
 
562 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.77 
 
 
562 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.71 
 
 
554 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.2733e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.96 
 
 
562 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.96 
 
 
562 aa  391  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.59 
 
 
562 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.77 
 
 
562 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.59 
 
 
562 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.77 
 
 
562 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.59 
 
 
562 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.59 
 
 
562 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.29 
 
 
562 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.22 
 
 
588 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.5496e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.19 
 
 
547 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.32 
 
 
589 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  1.54817e-05 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.25 
 
 
527 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  8.33689e-06 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  37.82 
 
 
568 aa  360  3e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.85 
 
 
565 aa  358  1e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.85 
 
 
565 aa  358  1e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.5 
 
 
522 aa  355  1e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.35 
 
 
540 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.75 
 
 
611 aa  353  4e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0950425  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0052  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.67 
 
 
547 aa  350  4e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0055  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.95 
 
 
547 aa  349  1e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.06 
 
 
427 aa  345  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.8 
 
 
567 aa  342  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.46 
 
 
562 aa  340  4e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  2.27385e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.82 
 
 
447 aa  340  4e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  3.24435e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  43.75 
 
 
499 aa  339  8e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.58 
 
 
582 aa  337  5e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  45.56 
 
 
579 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.97 
 
 
550 aa  333  7e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45 
 
 
582 aa  331  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.74 
 
 
586 aa  330  5e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.1 
 
 
518 aa  329  7e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.08 
 
 
732 aa  329  9e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45 
 
 
579 aa  329  9e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0828  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.84 
 
 
554 aa  326  8e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.8 
 
 
579 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0368  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  49.83 
 
 
602 aa  325  1e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.000122178 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  44.72 
 
 
548 aa  325  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.86 
 
 
550 aa  324  3e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.75 
 
 
602 aa  323  6e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  38.76 
 
 
582 aa  321  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.45747e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.69 
 
 
518 aa  318  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.58 
 
 
569 aa  316  9e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2852  DNA-directed DNA polymerase  39.15 
 
 
955 aa  312  9e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00013426  hitchhiker  9.46714e-07 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.16 
 
 
599 aa  311  3e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0857  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.78 
 
 
681 aa  311  3e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.03 
 
 
591 aa  311  3e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.2 
 
 
939 aa  310  5e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  8.37393e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2506  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.3 
 
 
553 aa  308  2e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.47 
 
 
460 aa  308  2e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2107  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.98 
 
 
534 aa  308  2e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00560473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.02 
 
 
649 aa  307  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  42.62 
 
 
900 aa  306  6e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1508  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.67 
 
 
948 aa  306  7e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  4.66847e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3039  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.64 
 
 
678 aa  306  7e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.21 
 
 
478 aa  306  8e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1335  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.28 
 
 
690 aa  306  1e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0235479  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1793  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.75 
 
 
911 aa  305  1e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00315607  hitchhiker  3.97841e-07 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.94 
 
 
551 aa  305  2e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  34.09 
 
 
559 aa  305  2e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2897  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.81 
 
 
914 aa  304  2e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.579528  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.72 
 
 
478 aa  305  2e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1076  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.66 
 
 
685 aa  304  3e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258766  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.73 
 
 
632 aa  304  3e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.32 
 
 
570 aa  303  5e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.39 
 
 
517 aa  303  5e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  35.42 
 
 
562 aa  303  5e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1073  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.44 
 
 
553 aa  303  9e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.4 
 
 
774 aa  302  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.6 
 
 
1045 aa  302  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00214919  hitchhiker  0.000897105 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02443  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.69 
 
 
698 aa  302  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3235  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.3 
 
 
690 aa  302  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00193084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1805  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.22 
 
 
696 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  42.34 
 
 
807 aa  301  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2446  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.73 
 
 
1040 aa  301  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00022165  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.53 
 
 
398 aa  301  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.561354 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4269  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.22 
 
 
691 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3587  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.22 
 
 
689 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.55 
 
 
735 aa  301  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3834  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.22 
 
 
687 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.471872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3744  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  45.15 
 
 
715 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1599  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.22 
 
 
692 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0852408 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1322  DNA-directed DNA polymerase  39.68 
 
 
396 aa  301  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.403308  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.04 
 
 
1071 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000102262  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.75 
 
 
664 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176808  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0529  DNA-directed DNA polymerase  35.28 
 
 
696 aa  301  3e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.24921e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1123  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.69 
 
 
543 aa  301  3e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.920332  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1217  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.69 
 
 
601 aa  301  3e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44630  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.53 
 
 
701 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522569  normal  0.208913 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2381  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.9 
 
 
921 aa  301  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.91992e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2235  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.06 
 
 
1113 aa  300  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00400296  decreased coverage  4.93259e-05 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.01 
 
 
395 aa  300  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03087  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.78 
 
 
736 aa  300  5e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3801  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.18 
 
 
681 aa  300  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>