More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0002 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 
370 aa  754  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  7.29086e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  38.81 
 
 
367 aa  281  9e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.48 
 
 
378 aa  255  1e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  1.67002e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.36 
 
 
366 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.36 
 
 
366 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  35.58 
 
 
381 aa  245  7e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  3.41772e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  35.58 
 
 
381 aa  245  7e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  35.25 
 
 
379 aa  242  8e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  35.79 
 
 
377 aa  242  9e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37 
 
 
365 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.25 
 
 
379 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  35.25 
 
 
379 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  8.20509e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.25 
 
 
379 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.25 
 
 
379 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.49 
 
 
381 aa  239  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.55 
 
 
381 aa  239  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  35.25 
 
 
379 aa  239  7e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.25 
 
 
379 aa  239  7e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.55 
 
 
378 aa  234  2e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.58 
 
 
377 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.58 
 
 
377 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  33.06 
 
 
366 aa  218  9e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  34.29 
 
 
376 aa  216  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.10658e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.61 
 
 
366 aa  215  1e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  31.15 
 
 
367 aa  213  4e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  33.77 
 
 
376 aa  212  9e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0623e-09 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.95 
 
 
374 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  1.16577e-06 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  33.51 
 
 
376 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  8.41235e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  33.25 
 
 
376 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  33.25 
 
 
376 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  32.98 
 
 
376 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.35 
 
 
372 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  29.63 
 
 
378 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  33.77 
 
 
376 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  32.98 
 
 
376 aa  206  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  33.25 
 
 
376 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  32.2 
 
 
376 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  4.91978e-05 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.08 
 
 
365 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.82 
 
 
370 aa  203  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  32.98 
 
 
376 aa  202  1e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.88302e-11  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  30.59 
 
 
376 aa  200  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.27 
 
 
374 aa  198  1e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  29.18 
 
 
377 aa  195  8e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.55 
 
 
372 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.51 
 
 
380 aa  194  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.81 
 
 
366 aa  193  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  5.53224e-06  hitchhiker  3.89013e-07 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.71 
 
 
370 aa  192  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.5 
 
 
380 aa  192  8e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  28.65 
 
 
377 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  32.1 
 
 
372 aa  189  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.02 
 
 
372 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  28.38 
 
 
378 aa  187  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  1.28167e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  28.38 
 
 
378 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  5.12645e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  27.85 
 
 
378 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  3.28779e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.87 
 
 
372 aa  184  2e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.71 
 
 
374 aa  184  3e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  3.74529e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.48 
 
 
372 aa  183  4e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.38199e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.22 
 
 
372 aa  183  4e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  29.63 
 
 
374 aa  183  5e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3235  DNA polymerase III, beta subunit  30.42 
 
 
374 aa  183  5e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0867918 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  28.34 
 
 
373 aa  182  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.72 
 
 
367 aa  182  8e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.6 
 
 
372 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.59068e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.42 
 
 
372 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.59 
 
 
373 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.41 
 
 
372 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.88 
 
 
372 aa  178  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  27.81 
 
 
373 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.28 
 
 
388 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.81 
 
 
373 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.6 
 
 
373 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0002  DNA-directed DNA polymerase  29.89 
 
 
409 aa  174  2e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  31.2 
 
 
369 aa  174  3e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  3.52181e-08 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  27.42 
 
 
382 aa  173  4e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0662  DNA polymerase III, beta subunit  30.27 
 
 
366 aa  172  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  3.26321e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  27.7 
 
 
378 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0686  DNA polymerase III, beta subunit  28.92 
 
 
366 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0347365  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.88 
 
 
365 aa  169  5e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.34 
 
 
378 aa  168  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.15 
 
 
372 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.65 
 
 
375 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.65 
 
 
375 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.38 
 
 
375 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  27.15 
 
 
381 aa  167  3e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  1.66783e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  27.01 
 
 
373 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.27 
 
 
372 aa  166  6e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  27.25 
 
 
374 aa  166  6e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  5.79402e-05  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.7 
 
 
378 aa  166  6e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  26.54 
 
 
372 aa  166  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.15 
 
 
375 aa  166  8e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  4.18991e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.88 
 
 
372 aa  165  1e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1549  DNA polymerase III, beta subunit  28.88 
 
 
374 aa  164  2e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15445  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  30.65 
 
 
367 aa  164  2e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.34 
 
 
376 aa  164  2e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.75 
 
 
366 aa  164  2e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.366013 
 
 
-
 
NC_002620  TC0347  DNA polymerase III subunit beta  29.27 
 
 
366 aa  164  3e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.55 
 
 
387 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0616  DNA polymerase III, beta subunit  28.18 
 
 
372 aa  163  4e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.56 
 
 
385 aa  163  4e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.54 
 
 
397 aa  162  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>