75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4952 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4952  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 		 297 aa  570  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.329094  decreased coverage  0.00411205 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1538  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  48.03 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  48.09 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2154  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  46.94 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  0.535003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1480  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  51.24 
 
 		 304 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113163  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12892  integral membrane protein  48.25 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2362  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.53 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0199448  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.82 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302947  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4520  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.84 
 
 		 341 aa  99  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0845722 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4527  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.54 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3217  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.88 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0753404  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2079  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.95 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2962  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.19 
 
 		 224 aa  62  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.7 
 
 		 231 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4519  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.08 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0363531 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0445  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.42 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.362789  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07210  cytochrome c biogenesis protein  33.33 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.276836 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4478  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.66 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4309  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.66 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117194  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4209  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.66 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0270  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.28 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0502  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.43 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0584  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  27.06 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0549  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  27.15 
 
 		 248 aa  53.1  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000031904  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4432  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.81 
 
 		 266 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229211  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1951  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.81 
 
 		 237 aa  52.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2966  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.03 
 
 		 247 aa  52.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017508  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.05 
 
 		 244 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.73 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  29.36 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  24.2 
 
 		 403 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.82 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  23.74 
 
 		 403 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.1 
 
 		 244 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4485  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.09 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2214  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.7 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4562  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.41 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2162  cytochrome c-type biogenesis protein  28.26 
 
 		 248 aa  46.6  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20604  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2813  putative transmembrane cytochrome C biogenesis protein  25.81 
 
 		 244 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2596  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.11 
 
 		 236 aa  46.2  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3645  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.85 
 
 		 249 aa  46.2  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2284  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.43 
 
 		 223 aa  45.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000156188  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0511  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.58 
 
 		 311 aa  45.8  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.166035  normal  0.182219 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1830  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.57 
 
 		 227 aa  45.8  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4210  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.02 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5329  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.56 
 
 		 256 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.262903  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3695  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  20.6 
 
 		 235 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1037  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.78 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3727  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  21.03 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3417  cytochrome c-type biogenesis protein (holocytochrome-c synthase)  20.6 
 
 		 235 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.297726  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3455  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  21.03 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3679  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  21.03 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5681  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.74 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.728105 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3703  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  20.6 
 
 		 235 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  23.77 
 
 		 611 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3348  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  21.03 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000571426  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0051  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.02 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5368  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.38 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1771  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.96 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1548  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  21.03 
 
 		 235 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00245036  hitchhiker  0.0095954 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3367  cytochrome c-type biogenesis protein (holocytochrome-c synthase)  20.6 
 
 		 235 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260903  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3606  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.24 
 
 		 240 aa  43.5  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507935  normal  0.590973 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3944  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.24 
 
 		 240 aa  43.5  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1262  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.01 
 
 		 235 aa  43.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3785  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.67 
 
 		 243 aa  43.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2825  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.51 
 
 		 257 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447777  normal  0.192447 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  23.77 
 
 		 611 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3768  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  21.03 
 
 		 235 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0366104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1109  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.46 
 
 		 237 aa  42.7  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1553  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.25 
 
 		 247 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4125  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.02 
 
 		 399 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0162627 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0522  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.62 
 
 		 258 aa  42.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0219549  hitchhiker  0.00315047 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3204  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.65 
 
 		 247 aa  42.4  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3693  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.33 
 
 		 256 aa  42.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>