56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4856 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 110 aa  216  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  58.49 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  59.43 
 
 		 114 aa  123  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  59.43 
 
 		 114 aa  123  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  59.43 
 
 		 114 aa  123  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  58.49 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  61.32 
 
 		 110 aa  120  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.55 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  59.63 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  56.6 
 
 		 109 aa  117  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  55.14 
 
 		 277 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.14 
 
 		 132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.43 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  52.83 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  49.06 
 
 		 110 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  55.66 
 
 		 111 aa  107  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  49.06 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  51.89 
 
 		 110 aa  104  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.17 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  53.01 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  49.53 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  49.51 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  51.46 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  48.11 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  43.64 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  43.96 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  42.05 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31480  hypothetical protein  38.1 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  37.14 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  35.37 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  35.29 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  36.76 
 
 		 117 aa  47.4  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  38 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  35.71 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.88 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  32.35 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  32.71 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0361  hypothetical protein  36.14 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642928  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  33.78 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0991  hypothetical protein  31.43 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.166279  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.02 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  42.19 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  29.41 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  35.44 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 106 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  29.7 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19880  hypothetical protein  37.14 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406618  hitchhiker  0.00288351 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 111 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 106 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>