144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4769 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4769  ATPase  100 
 
 		 899 aa  1816    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.55 
 
 		 743 aa  350  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  36.88 
 
 		 743 aa  347  7e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  43.07 
 
 		 853 aa  332  1e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  41.73 
 
 		 698 aa  325  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.71 
 
 		 729 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.59 
 
 		 626 aa  294  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  35.21 
 
 		 741 aa  242  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.78 
 
 		 502 aa  181  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  39.69 
 
 		 539 aa  176  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  41.91 
 
 		 629 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.11 
 
 		 683 aa  170  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  38.2 
 
 		 459 aa  165  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.73 
 
 		 568 aa  165  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  38.2 
 
 		 459 aa  165  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.83 
 
 		 465 aa  164  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.77 
 
 		 732 aa  159  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  36.86 
 
 		 805 aa  156  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.23 
 
 		 765 aa  154  7e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  39.5 
 
 		 822 aa  154  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  37.59 
 
 		 700 aa  154  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.49 
 
 		 421 aa  147  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  37.69 
 
 		 609 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  37.69 
 
 		 609 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  36.82 
 
 		 734 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  37.96 
 
 		 781 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.04 
 
 		 590 aa  140  7e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  36.73 
 
 		 587 aa  140  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.14 
 
 		 754 aa  139  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  30.5 
 
 		 638 aa  139  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  43.46 
 
 		 655 aa  138  5e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  42.41 
 
 		 810 aa  137  8e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.5 
 
 		 530 aa  137  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  34.93 
 
 		 705 aa  134  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  35.36 
 
 		 678 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  35.75 
 
 		 691 aa  129  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  36.2 
 
 		 685 aa  128  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.45 
 
 		 685 aa  127  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  35.09 
 
 		 303 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  32.44 
 
 		 999 aa  114  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.35 
 
 		 398 aa  110  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.1 
 
 		 723 aa  108  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  33.73 
 
 		 481 aa  106  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.31 
 
 		 795 aa  105  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  33.91 
 
 		 450 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.17 
 
 		 585 aa  105  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  33.99 
 
 		 845 aa  104  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  29.96 
 
 		 851 aa  104  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  40.66 
 
 		 834 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  38.46 
 
 		 662 aa  102  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  37.14 
 
 		 603 aa  102  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  32.16 
 
 		 653 aa  100  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  41.46 
 
 		 862 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  28.46 
 
 		 412 aa  99.8  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  40 
 
 		 498 aa  98.2  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  39.51 
 
 		 517 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  38.57 
 
 		 498 aa  97.4  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  37.64 
 
 		 571 aa  96.7  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  38.33 
 
 		 605 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  38.2 
 
 		 687 aa  95.9  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.93 
 
 		 449 aa  95.9  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  35.63 
 
 		 696 aa  95.5  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  37.72 
 
 		 517 aa  95.1  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.51 
 
 		 603 aa  92.4  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  38.18 
 
 		 900 aa  92.8  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  47.79 
 
 		 598 aa  90.9  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  27.89 
 
 		 666 aa  90.1  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  36.69 
 
 		 722 aa  90.1  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  27.17 
 
 		 352 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.38 
 
 		 510 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.15 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1956  ATPase  25.64 
 
 		 938 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  28.92 
 
 		 513 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  28 
 
 		 513 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.64 
 
 		 530 aa  77.4  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.87 
 
 		 748 aa  74.7  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  28.76 
 
 		 803 aa  70.5  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.89 
 
 		 559 aa  63.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.32 
 
 		 559 aa  62.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0015  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  23.68 
 
 		 597 aa  62  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.89 
 
 		 651 aa  61.2  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.82 
 
 		 668 aa  55.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0069  ATPase  29.12 
 
 		 475 aa  55.5  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.977375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5205  AAA ATPase  25.89 
 
 		 371 aa  55.5  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1001  ATPase  27.48 
 
 		 474 aa  55.5  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00172806  hitchhiker  0.00521543 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  27.32 
 
 		 844 aa  55.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  23.11 
 
 		 583 aa  54.7  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  27.56 
 
 		 792 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  28.96 
 
 		 847 aa  54.3  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  28.96 
 
 		 843 aa  54.3  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  27.32 
 
 		 844 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1053  ATPase  30.49 
 
 		 523 aa  53.5  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.603764 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.67 
 
 		 606 aa  51.2  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.31 
 
 		 381 aa  51.2  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3197  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.13 
 
 		 542 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.046131  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0004  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  23.43 
 
 		 914 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928262  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0028  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  24.57 
 
 		 751 aa  50.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1992  ATPase  28.68 
 
 		 589 aa  48.9  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1943  ATPase  30.88 
 
 		 403 aa  48.5  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.587571  hitchhiker  0.00000000309284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  29.05 
 
 		 390 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>