34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4709 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1572  ATP-binding protein  71.95 
 
 		 496 aa  741    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4709  hypothetical protein  100 
 
 		 511 aa  1045    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0831911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0687  ATP-binding protein  58.81 
 
 		 502 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2243  ATP-binding protein  52.85 
 
 		 512 aa  507  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  39.69 
 
 		 515 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8941  hypothetical protein  38.21 
 
 		 505 aa  306  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57395  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5522  hypothetical protein  28.81 
 
 		 516 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349353  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  30.48 
 
 		 711 aa  156  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  30.04 
 
 		 495 aa  150  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7298  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  29.82 
 
 		 696 aa  150  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06480  type IV secretory pathway VirB4 component-like protein  28.6 
 
 		 500 aa  146  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132231  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  29.32 
 
 		 495 aa  142  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  29.55 
 
 		 495 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0444  hypothetical protein  29.02 
 
 		 509 aa  139  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1342  ATP-binding protein  26.38 
 
 		 461 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3322  putative ATP-binding protein  27.62 
 
 		 480 aa  105  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.540198 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4215  hypothetical protein  27.65 
 
 		 518 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4502  hypothetical protein  26.45 
 
 		 528 aa  97.8  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.689738  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4559  hypothetical protein  27.68 
 
 		 485 aa  93.6  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.168528 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4277  hypothetical protein  25.05 
 
 		 539 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  25.52 
 
 		 569 aa  83.2  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4943  hypothetical protein  24.89 
 
 		 624 aa  80.5  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0368  ATPase  31.87 
 
 		 532 aa  77.4  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0513969  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.52 
 
 		 629 aa  76.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8298  hypothetical protein  25.06 
 
 		 575 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  27.42 
 
 		 629 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.74 
 
 		 630 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.88 
 
 		 631 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  23.21 
 
 		 621 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  21.6 
 
 		 610 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0205  AAA ATPase  25.68 
 
 		 385 aa  51.2  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.519462  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  22.89 
 
 		 747 aa  45.8  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0565  hypothetical protein  30.56 
 
 		 945 aa  44.3  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  26.39 
 
 		 616 aa  43.5  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>