More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4676 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 778 aa  1586    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  39.88 
 
 		 764 aa  418  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.48 
 
 		 764 aa  413  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.02 
 
 		 1129 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  38.91 
 
 		 724 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  38.79 
 
 		 859 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  39.03 
 
 		 719 aa  385  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  37.46 
 
 		 695 aa  380  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  37.92 
 
 		 1117 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.94 
 
 		 747 aa  378  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  35.17 
 
 		 836 aa  361  3e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  37.56 
 
 		 822 aa  356  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  33.56 
 
 		 825 aa  355  2e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  36.98 
 
 		 774 aa  351  2e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  34.96 
 
 		 808 aa  350  6e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  35.58 
 
 		 727 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  35.58 
 
 		 1306 aa  337  5e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.08 
 
 		 890 aa  335  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 		 806 aa  330  6e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 		 806 aa  330  6e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 		 806 aa  330  6e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  34.33 
 
 		 961 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.68 
 
 		 725 aa  326  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  36.04 
 
 		 752 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  33.42 
 
 		 1245 aa  323  7e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  33.02 
 
 		 803 aa  317  7e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  34.9 
 
 		 1065 aa  316  9e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  33.16 
 
 		 978 aa  306  7e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.03 
 
 		 814 aa  300  6e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  32.23 
 
 		 867 aa  298  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.13 
 
 		 950 aa  297  5e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.19 
 
 		 769 aa  289  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  33.24 
 
 		 830 aa  287  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  32.22 
 
 		 821 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 975 aa  283  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 		 979 aa  279  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  32.85 
 
 		 732 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 		 815 aa  274  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  31.1 
 
 		 734 aa  273  8.000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  32.99 
 
 		 905 aa  271  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  32.54 
 
 		 643 aa  271  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  32.54 
 
 		 643 aa  271  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  32.44 
 
 		 838 aa  270  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  32.76 
 
 		 761 aa  265  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  30.6 
 
 		 618 aa  261  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2691  glycosyl transferase family 51  35.28 
 
 		 711 aa  260  8e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0728241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  31.73 
 
 		 643 aa  260  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0345  glycosyl transferase family 51  31.91 
 
 		 987 aa  259  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0145524 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  31.32 
 
 		 784 aa  259  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  33.72 
 
 		 648 aa  258  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  31.46 
 
 		 735 aa  257  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  32.49 
 
 		 734 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  31.84 
 
 		 720 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  31.3 
 
 		 704 aa  253  8.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  30.36 
 
 		 776 aa  253  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 		 819 aa  253  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  31.01 
 
 		 739 aa  253  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  33.09 
 
 		 807 aa  252  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  31.94 
 
 		 683 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  31.83 
 
 		 770 aa  251  5e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  30.17 
 
 		 730 aa  250  5e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  31.78 
 
 		 683 aa  250  9e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  30.17 
 
 		 763 aa  250  9e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  30.49 
 
 		 779 aa  249  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  31.57 
 
 		 833 aa  248  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  32.19 
 
 		 795 aa  248  3e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  30.06 
 
 		 683 aa  248  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  32.79 
 
 		 824 aa  247  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  31.37 
 
 		 712 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  31.32 
 
 		 640 aa  246  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  32.34 
 
 		 824 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  31.4 
 
 		 683 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  31.41 
 
 		 683 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  31.41 
 
 		 683 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  33.5 
 
 		 649 aa  244  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  31.55 
 
 		 706 aa  244  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  31.25 
 
 		 683 aa  243  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  31.27 
 
 		 776 aa  243  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  31.3 
 
 		 683 aa  243  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  31.14 
 
 		 683 aa  242  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  32.29 
 
 		 710 aa  242  2e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  30.28 
 
 		 750 aa  241  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  31.3 
 
 		 683 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  31.3 
 
 		 683 aa  241  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  29.57 
 
 		 625 aa  241  5e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  30.54 
 
 		 683 aa  241  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  30.45 
 
 		 640 aa  240  8e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  30.78 
 
 		 722 aa  239  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  31.72 
 
 		 680 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  31.72 
 
 		 680 aa  238  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  31.18 
 
 		 676 aa  238  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  30.65 
 
 		 680 aa  238  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  31.72 
 
 		 680 aa  238  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  31.72 
 
 		 673 aa  238  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  31.72 
 
 		 673 aa  238  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  31.61 
 
 		 680 aa  238  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  29.86 
 
 		 880 aa  237  8e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  31.55 
 
 		 667 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  31.55 
 
 		 680 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  32.29 
 
 		 710 aa  235  3e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>