86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4673 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  100 
 
 		 383 aa  769    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  63.17 
 
 		 370 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  50.13 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  33.24 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  32.48 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  28.61 
 
 		 366 aa  142  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  30.77 
 
 		 370 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  26.24 
 
 		 364 aa  99.8  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  28.7 
 
 		 359 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  25.14 
 
 		 341 aa  96.7  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  27.78 
 
 		 352 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  26.09 
 
 		 345 aa  95.1  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  24.16 
 
 		 347 aa  93.2  7e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  27.13 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  24.71 
 
 		 339 aa  90.9  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  27.88 
 
 		 366 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  25.64 
 
 		 354 aa  88.6  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  31.22 
 
 		 366 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  24.9 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  24.9 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  24.35 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  27.12 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  24.37 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  24.37 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  19.42 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  26.33 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  25.78 
 
 		 410 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0190  hypothetical protein  35.08 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0946  femA protein  22.94 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.70677  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  32.18 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0220  hypothetical protein  27.96 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  28.43 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  26.75 
 
 		 340 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  27.87 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1464  methicillin resistance protein  36.9 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.297112  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1435  methicillin resistance protein  36.9 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.452442  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  23.16 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2001  fmhA protein  21.32 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  29.51 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  28.33 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  30.25 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1307  methicillin resistance protein  19.31 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  24.5 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1332  methicillin resistance protein  19.31 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0318895  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3584  hypothetical protein  30.77 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  29.06 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  29.45 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  26.06 
 
 		 753 aa  63.5  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0509  beta-lactam resistance factor  20.51 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.695705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  30 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1791  hypothetical protein  26.59 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.344205 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0510  murM protein, putative  19.95 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  25.28 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  28.17 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0947  femB protein  19.95 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.453149  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  25.41 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  22.17 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  28.74 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0644  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  21.4 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  28.74 
 
 		 344 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1185  methicillin resistance protein  24.79 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1112  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  19.11 
 
 		 404 aa  53.9  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1465  methicillin resistance protein  22.5 
 
 		 419 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.109752  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1436  methicillin resistance protein  22.5 
 
 		 419 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.250722  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2484  methicillin resistance protein  24.75 
 
 		 416 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2436  methicillin resistance protein  24.75 
 
 		 416 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3349  hypothetical protein  24.88 
 
 		 364 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0882  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  19.03 
 
 		 388 aa  53.1  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1028  hypothetical protein  22.42 
 
 		 436 aa  52.4  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  25.14 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  26.32 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2372  UDP-N-acetylmuramoylpentapeptide-lysine N(6)-alanyltransferase  39.39 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1029  hypothetical protein  24.58 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  26.88 
 
 		 344 aa  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  24.62 
 
 		 331 aa  49.7  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  25.6 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  27.21 
 
 		 351 aa  47.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0508  beta-lactam resistance factor  26 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0830649  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  25.6 
 
 		 353 aa  46.6  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  29.37 
 
 		 342 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0062  putative FemAB family protein  27.06 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.731343 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  27.14 
 
 		 348 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0327  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  29.25 
 
 		 417 aa  43.9  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.297856  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  25 
 
 		 352 aa  43.5  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1442  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  24.77 
 
 		 422 aa  43.1  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0886  Methicillin resistance protein  28.12 
 
 		 437 aa  42.7  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>