More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4645 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4645  patatin  100 
 
 		 310 aa  599  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  58.56 
 
 		 290 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  45.29 
 
 		 291 aa  235  8e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  44.25 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  44.52 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  47.99 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  44.78 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  43.43 
 
 		 312 aa  208  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  47.49 
 
 		 303 aa  208  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  46.74 
 
 		 306 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0501  patatin  42.18 
 
 		 293 aa  201  9e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  46.36 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  35.94 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  34.85 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7395  patatin  35.17 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2490  Patatin  38.82 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  34.8 
 
 		 306 aa  105  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3682  patatin  33.03 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4059  patatin  33.63 
 
 		 276 aa  90.9  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447897  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2824  Patatin  37.08 
 
 		 357 aa  90.1  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.701199  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6465  patatin  33.71 
 
 		 286 aa  89.4  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  34.03 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  30.43 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  36.42 
 
 		 315 aa  86.3  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  36.42 
 
 		 315 aa  86.3  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  31.03 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  25.48 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  33.16 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  35.87 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  35.14 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  33.33 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  28.3 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  35.48 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  32.11 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  26.48 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  32.97 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  33.8 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  32.97 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  29.67 
 
 		 263 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  32.97 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  31.19 
 
 		 746 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  30.99 
 
 		 252 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  34.05 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  29.71 
 
 		 754 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  31.64 
 
 		 753 aa  74.3  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3127  patatin  32.09 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  28.57 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  28.57 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  29.12 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3052  patatin  29.92 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.443611  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  35.45 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  29.12 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  28.99 
 
 		 733 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  29.12 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  29.12 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  28.68 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  33.7 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  29.12 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  28.08 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  31.93 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  30.77 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  31.76 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  33.15 
 
 		 348 aa  72.4  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  30.17 
 
 		 332 aa  72.4  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  33.33 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  28.57 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  30.8 
 
 		 790 aa  72.4  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0830  Patatin  29.23 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00263851  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0681  patatin-like phospholipase family protein  29.23 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  28.68 
 
 		 777 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2623  patatin  32.79 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0385483  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  33.51 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  28.28 
 
 		 728 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0014  patatin  35.48 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1661  patatin  34.12 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2836  hypothetical protein  33.53 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  35.29 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1646  patatin  34.12 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  30.43 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  33.51 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1683  patatin  34.12 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2697  Patatin  34.12 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00646422  hitchhiker  0.0000697088 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  28.88 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  27.89 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  34.24 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  31.65 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  32.11 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1595  patatin  27.71 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.613745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0922  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.93 
 
 		 597 aa  70.1  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1538  patatin  33.53 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.546797  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  25.86 
 
 		 741 aa  70.1  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1401  patatin  27.64 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0324222  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  34.43 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  30.43 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  33.33 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  30.65 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  32.74 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  30.6 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  35.76 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2605  patatin  32.35 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>