More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4628 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 477 aa  942    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  60.04 
 
 		 468 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  60.04 
 
 		 468 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  60.31 
 
 		 443 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  56.66 
 
 		 471 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  56.99 
 
 		 477 aa  504  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  57.27 
 
 		 459 aa  495  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  55 
 
 		 464 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  55.56 
 
 		 473 aa  476  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  55 
 
 		 464 aa  475  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  56.16 
 
 		 464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  53.57 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  47.61 
 
 		 487 aa  375  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  39.26 
 
 		 470 aa  336  3.9999999999999995e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  44.98 
 
 		 457 aa  335  7.999999999999999e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  35.01 
 
 		 465 aa  290  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  37.25 
 
 		 463 aa  286  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 		 483 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 		 486 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 496 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  33.78 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 453 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  34.75 
 
 		 466 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 		 466 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  33.92 
 
 		 463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  33.48 
 
 		 463 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  33.48 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 472 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 486 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 463 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 		 462 aa  163  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  32.6 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 		 521 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  30.89 
 
 		 466 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 462 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  32.27 
 
 		 462 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  31.58 
 
 		 462 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 		 460 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  32.24 
 
 		 465 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  35.54 
 
 		 473 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 		 491 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 465 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  31.35 
 
 		 462 aa  156  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 		 473 aa  154  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  32.65 
 
 		 475 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  31.15 
 
 		 460 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  31.58 
 
 		 465 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 460 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 		 460 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 460 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  31.02 
 
 		 466 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  30.8 
 
 		 474 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1019  FAD dependent oxidoreductase  35.08 
 
 		 424 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 456 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  28.51 
 
 		 466 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 472 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  31.43 
 
 		 437 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  29.14 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 463 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 427 aa  141  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 435 aa  140  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  31.73 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  30.79 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  31.53 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 		 435 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  30.55 
 
 		 430 aa  136  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 		 464 aa  136  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  30.05 
 
 		 435 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 		 491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 		 435 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  27.5 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 		 437 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  32.59 
 
 		 431 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  31.44 
 
 		 468 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 435 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 435 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 435 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 433 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 491 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 423 aa  133  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 		 435 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 435 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  30.05 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>