More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4590 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 518 aa  1018    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  60.04 
 
 		 532 aa  580  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  60.69 
 
 		 521 aa  558  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  56.46 
 
 		 527 aa  551  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  57.88 
 
 		 528 aa  547  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  59.46 
 
 		 540 aa  535  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  54.94 
 
 		 527 aa  524  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  55.81 
 
 		 525 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  55.81 
 
 		 525 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  55.81 
 
 		 525 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  53.82 
 
 		 529 aa  519  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  55.94 
 
 		 545 aa  489  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  53.4 
 
 		 531 aa  481  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.63 
 
 		 572 aa  472  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  53.17 
 
 		 521 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  53.28 
 
 		 520 aa  464  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  55.66 
 
 		 524 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  49.91 
 
 		 550 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  49.49 
 
 		 534 aa  395  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  39.82 
 
 		 556 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.02 
 
 		 533 aa  338  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  35.87 
 
 		 563 aa  333  3e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  38.78 
 
 		 552 aa  333  4e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  39.14 
 
 		 531 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  38.76 
 
 		 531 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.24 
 
 		 531 aa  319  6e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.31 
 
 		 568 aa  316  5e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  38.43 
 
 		 584 aa  313  5.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  36.88 
 
 		 554 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  36.61 
 
 		 583 aa  307  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.05 
 
 		 534 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  33.52 
 
 		 559 aa  295  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.52 
 
 		 565 aa  292  9e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.05 
 
 		 557 aa  288  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  41.94 
 
 		 546 aa  284  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  31.37 
 
 		 586 aa  275  2.0000000000000002e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  34.52 
 
 		 538 aa  266  8e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.7 
 
 		 579 aa  262  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  36.33 
 
 		 532 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.8 
 
 		 564 aa  254  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  37.95 
 
 		 531 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  37.28 
 
 		 532 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.62 
 
 		 536 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  37.61 
 
 		 527 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.57 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.62 
 
 		 467 aa  239  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  35.86 
 
 		 465 aa  233  5e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  33.91 
 
 		 534 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  33.19 
 
 		 534 aa  226  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.96 
 
 		 510 aa  226  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  32.77 
 
 		 502 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  35.6 
 
 		 470 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.26 
 
 		 520 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.2 
 
 		 516 aa  203  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.31 
 
 		 516 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  32.94 
 
 		 517 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  33.18 
 
 		 520 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.67 
 
 		 523 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  31.28 
 
 		 513 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  26.49 
 
 		 484 aa  167  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.49 
 
 		 484 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  26.69 
 
 		 484 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  26.49 
 
 		 484 aa  166  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  26.49 
 
 		 484 aa  166  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  26.28 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  26.28 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  26.53 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  27.35 
 
 		 554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  26.28 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  28.83 
 
 		 451 aa  152  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  26.76 
 
 		 459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  30.73 
 
 		 499 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  39.1 
 
 		 572 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.65 
 
 		 474 aa  146  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  28.78 
 
 		 472 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.72 
 
 		 473 aa  144  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  30.05 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  26.13 
 
 		 459 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  31.96 
 
 		 469 aa  141  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  29.82 
 
 		 472 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2031  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.71 
 
 		 492 aa  139  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  30.48 
 
 		 495 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.59 
 
 		 476 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.13 
 
 		 469 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.09 
 
 		 462 aa  137  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  25.21 
 
 		 461 aa  136  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  27.84 
 
 		 466 aa  136  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  27.27 
 
 		 457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  25.9 
 
 		 466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.66 
 
 		 482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.39 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  28.57 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1299  FAD linked oxidase-like  30.02 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.913204  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1985  FAD linked oxidase-like  31.22 
 
 		 465 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  27.21 
 
 		 462 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  31.1 
 
 		 455 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  28.47 
 
 		 471 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.15 
 
 		 469 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.96 
 
 		 453 aa  133  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.05 
 
 		 469 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>