138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4559 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4559  prolyl aminopeptidase 2  100 
 
 
421 aa  833    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2021  putative proline iminopeptidase  63.08 
 
 
419 aa  485  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7145  alpha/beta hydrolase fold protein  59.86 
 
 
423 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152071 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6521  alpha/beta hydrolase fold protein  57.66 
 
 
432 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.17034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06790  prolyl aminopeptidase 2  56.49 
 
 
441 aa  404  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2460  alpha/beta hydrolase fold  47.48 
 
 
453 aa  405  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3689  putative prolyl aminopeptidase  50.84 
 
 
430 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798401  normal  0.360636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4714  alpha/beta hydrolase fold protein  50.24 
 
 
439 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0398  alpha/beta hydrolase fold protein  47.34 
 
 
428 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167053  normal  0.0238108 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1634  alpha/beta hydrolase fold  41.99 
 
 
433 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16021  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2227  alpha/beta hydrolase fold  41.94 
 
 
429 aa  351  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3055  proline iminopeptidase  43.58 
 
 
424 aa  349  5e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0134  alpha/beta hydrolase fold protein  54.03 
 
 
420 aa  349  6e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2270  alpha/beta hydrolase fold  42.96 
 
 
429 aa  348  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.201892 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1813  alpha/beta hydrolase fold protein  49.29 
 
 
439 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2828  alpha/beta hydrolase fold  42.45 
 
 
429 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2752  alpha/beta hydrolase fold  42.21 
 
 
429 aa  345  6e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1661  alpha/beta hydrolase fold  42.23 
 
 
429 aa  346  6e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.485679  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2429  alpha/beta hydrolase fold  41.49 
 
 
429 aa  344  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1492  prolyl aminopeptidase 2  42.69 
 
 
429 aa  344  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2735  alpha/beta hydrolase fold  41.97 
 
 
429 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1410  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 
454 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0646  hydrolase, alpha/beta domain protein  44.32 
 
 
460 aa  342  5.999999999999999e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.291247 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1624  alpha/beta hydrolase fold protein  41.73 
 
 
429 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.610603  normal  0.321544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3642  alpha/beta hydrolase fold protein  48.33 
 
 
412 aa  340  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1434  prolyl aminopeptidase 2  41.97 
 
 
429 aa  339  4e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1499  prolyl aminopeptidase 2  41.73 
 
 
429 aa  339  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2955  alpha/beta hydrolase fold  41.79 
 
 
431 aa  338  9e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0669  putative hydrolse  48.08 
 
 
447 aa  335  7e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.272037  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2143  alpha/beta hydrolase fold  43.87 
 
 
439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22944  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001130  putative prolyl aminopeptidase  41.67 
 
 
431 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.047339  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2072  alpha/beta hydrolase fold  46.12 
 
 
463 aa  326  6e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612042  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3903  alpha/beta hydrolase fold  47.97 
 
 
426 aa  303  3.0000000000000004e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0642789 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05870  prolyl aminopeptidase 2  44.6 
 
 
424 aa  279  6e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208476  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11240  hypothetical protein with alpha/beta hydrolase fold  42.09 
 
 
488 aa  273  4.0000000000000004e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.163814  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02092  Putative prolyl aminopeptidase Fragment (EC 3.4.11.5) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VT1]  36.72 
 
 
443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.707401  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33188  predicted protein  36.42 
 
 
510 aa  250  3e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.860325  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00350  prolyl aminopeptidase 2  38.76 
 
 
443 aa  232  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.358137 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48996  prolyl aminopeptidase  32.33 
 
 
478 aa  207  3e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.750097  normal  0.224061 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47448  predicted protein  30.54 
 
 
692 aa  189  5.999999999999999e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.445648  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  26.41 
 
 
508 aa  58.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  26.53 
 
 
527 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  31.43 
 
 
302 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  26.58 
 
 
519 aa  56.2  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  25.11 
 
 
480 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  27.27 
 
 
533 aa  54.3  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  28.69 
 
 
301 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2042  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 
291 aa  53.1  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
287 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  29.65 
 
 
546 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  29.37 
 
 
335 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  27.05 
 
 
291 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  25.76 
 
 
507 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  26.44 
 
 
535 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  26.44 
 
 
535 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 
291 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  31.09 
 
 
318 aa  50.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2329  hydrolase, alpha/beta fold family  27.87 
 
 
291 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000968473  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  26.32 
 
 
524 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  27.05 
 
 
301 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2001  proline iminopeptidase  27.05 
 
 
301 aa  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000475333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  27.05 
 
 
303 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  27.05 
 
 
301 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2199  hydrolase, alpha/beta fold family  27.05 
 
 
291 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  27.05 
 
 
301 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  28.64 
 
 
507 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4965  proline iminopeptidase  30.77 
 
 
308 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328745  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  27.14 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  28.9 
 
 
549 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  26.15 
 
 
533 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  26.7 
 
 
521 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  28.9 
 
 
540 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  22.65 
 
 
645 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  28.9 
 
 
545 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  30.08 
 
 
306 aa  47.8  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04709  prolyl aminopeptidase protein  37.96 
 
 
320 aa  47.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_004310  BR0314  proline iminopeptidase  28.67 
 
 
316 aa  47.4  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  25.86 
 
 
539 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4358  proline iminopeptidase  32.81 
 
 
361 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0513684  normal  0.622811 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  27.17 
 
 
538 aa  47.4  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3085  proline iminopeptidase  29.94 
 
 
345 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0863  proline iminopeptidase  26.12 
 
 
318 aa  47  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  27.43 
 
 
539 aa  46.6  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
305 aa  47  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0330  proline iminopeptidase  28.67 
 
 
342 aa  47  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  25.14 
 
 
527 aa  47  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  23.78 
 
 
313 aa  46.6  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 
280 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  29.02 
 
 
521 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  31.53 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2487  Prolyl aminopeptidase  32 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3668  proline iminopeptidase  29.71 
 
 
330 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  30.11 
 
 
740 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  34.75 
 
 
318 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  32.82 
 
 
320 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  22.3 
 
 
517 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  33.59 
 
 
320 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  27.03 
 
 
513 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  26.69 
 
 
511 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4916  proline iminopeptidase  30.6 
 
 
312 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>