20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4540 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4540  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0452  hypothetical protein  47.57 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0516  hypothetical protein  45.54 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1208  hypothetical protein  41.51 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1101  hypothetical protein  41.51 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121424  normal  0.0518739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2700  hypothetical protein  33.64 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5015  hypothetical protein  31.86 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0636  hypothetical protein  44.16 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00923819  hitchhiker  0.000274173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6116  hypothetical protein  29.37 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550687  normal  0.46326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0576  hypothetical protein  34.44 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0514  hypothetical protein  29.17 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3081  hypothetical protein  30.84 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24220  hypothetical protein  30.93 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4427  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0273  hypothetical protein  35 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3287  hypothetical protein  30.56 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8074  hypothetical protein  29.27 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3250  hypothetical protein  33.7 
 
 		 150 aa  42.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246975  normal  0.219579 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1705  hypothetical protein  38 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0448  hypothetical protein  30.53 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>