242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4537 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4537  hypothetical protein  100 
 
 
667 aa  1338    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.229647  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10455  hypothetical protein  61.56 
 
 
439 aa  473  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2362  amine oxidase  58.2 
 
 
454 aa  465  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1250  amine oxidase  60 
 
 
428 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00507419  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2919  amine oxidase  61.58 
 
 
413 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104763  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2122  amine oxidase  57.83 
 
 
465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160745 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0102  amine oxidase  60.71 
 
 
465 aa  439  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0298  amine oxidase  57.18 
 
 
429 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3583  amine oxidase  56.97 
 
 
421 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4269  amine oxidase  52.79 
 
 
445 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2327  hypothetical protein  46.77 
 
 
414 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01779  dehydrogenase  45.17 
 
 
409 aa  323  9.000000000000001e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0510493  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4724  amine oxidase  47.02 
 
 
421 aa  322  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1555  amine oxidase  46.23 
 
 
445 aa  317  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.5068 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0638  hypothetical protein  40.48 
 
 
426 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000186691  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1390  amine oxidase  42.45 
 
 
445 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0129  hypothetical protein  43.8 
 
 
414 aa  311  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0958  amine oxidase, flavin-containing  41.55 
 
 
415 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6583  FAD dependent oxidoreductase  44.31 
 
 
435 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1118  amine oxidase, flavin-containing protein  41.55 
 
 
415 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3381  hypothetical protein  40.14 
 
 
416 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4072  amine oxidase  37.5 
 
 
416 aa  307  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.693433  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003863  amine oxidase flavin-containing  39.85 
 
 
436 aa  307  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0462  FAD dependent oxidoreductase  43.91 
 
 
441 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1239  amine oxidase  39.33 
 
 
416 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1168  amine oxidase  39.33 
 
 
416 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3017  amine oxidase  42.27 
 
 
415 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1489  amine oxidase  42.26 
 
 
419 aa  303  9e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1869  amine oxidase  41.69 
 
 
462 aa  302  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1169  amine oxidase  39.33 
 
 
416 aa  302  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0236  putative dehydrogenase  43.69 
 
 
441 aa  300  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3208  amine oxidase  40.43 
 
 
416 aa  300  7e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.884279 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1485  amine oxidase  41.08 
 
 
421 aa  300  7e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.584042  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01816  hypothetical protein  38.61 
 
 
436 aa  300  8e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3051  amine oxidase  40.43 
 
 
416 aa  300  8e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3065  amine oxidase  40.43 
 
 
416 aa  300  8e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1068  amine oxidase  40.82 
 
 
415 aa  299  9e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0350  amine oxidase  39.42 
 
 
423 aa  299  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6096  FAD dependent oxidoreductase  41.63 
 
 
430 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0754929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4739  amine oxidase  41.55 
 
 
415 aa  298  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3370  amine oxidase  38.19 
 
 
417 aa  298  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3433  putative dehydrogenase  42.34 
 
 
433 aa  297  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0088  amine oxidase flavin-containing  41.99 
 
 
435 aa  296  9e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1616  amine oxidase  44.8 
 
 
426 aa  296  9e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2736  amine oxidase  41.55 
 
 
415 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142464  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2098  amine oxidase  41.55 
 
 
415 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1956  amine oxidase  44.42 
 
 
425 aa  294  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.130753 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1312  amine oxidase  39.95 
 
 
416 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3173  amine oxidase  41.3 
 
 
415 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0714711  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5828  amine oxidase  43.57 
 
 
434 aa  293  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1045  FAD dependent oxidoreductase  42.31 
 
 
433 aa  292  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.687688 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1482  amine oxidase  39.42 
 
 
417 aa  292  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1001  amine oxidase  35.25 
 
 
418 aa  291  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.880623  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2025  amine oxidase  41.25 
 
 
447 aa  290  6e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0911  amine oxidase  42.68 
 
 
447 aa  290  6e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2711  amine oxidase  39.33 
 
 
416 aa  290  7e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01433  putative dehydrogenase  37.02 
 
 
421 aa  290  7e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.923495  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1383  hypothetical protein  37 
 
 
436 aa  289  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152417  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2774  amine oxidase  36.45 
 
 
417 aa  289  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.858792  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4842  amine oxidase  40.91 
 
 
458 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.265562  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3033  amine oxidase  37.44 
 
 
422 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.567673  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2098  amine oxidase  39.33 
 
 
422 aa  286  8e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0462  amine oxidase  41.84 
 
 
439 aa  284  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2253  amine oxidase  42.79 
 
 
451 aa  283  5.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1177  FAD dependent oxidoreductase  39.8 
 
 
420 aa  283  8.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.909891  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0723  amine oxidase  42.41 
 
 
461 aa  282  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.885481  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2556  FAD dependent oxidoreductase  41.19 
 
 
437 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0108905  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2437  amine oxidase  40.09 
 
 
424 aa  281  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0814  hypothetical protein  39.9 
 
 
420 aa  281  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5886  amine oxidase  43.02 
 
 
448 aa  280  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2398  FAD dependent oxidoreductase  41.22 
 
 
434 aa  280  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2971  FAD dependent oxidoreductase  40.75 
 
 
434 aa  279  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2468  amine oxidase, flavin-containing  36.67 
 
 
422 aa  277  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3571  amine oxidase  41.5 
 
 
461 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.689303  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2567  amine oxidase  40.38 
 
 
437 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.266165 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1449  amine oxidase  38.68 
 
 
434 aa  274  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2904  amine oxidase  40.19 
 
 
437 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1239  FAD dependent oxidoreductase  41.4 
 
 
424 aa  272  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0355742  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0273  amine oxidase  41.83 
 
 
449 aa  270  5.9999999999999995e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1053  FAD dependent oxidoreductase  39.86 
 
 
457 aa  270  7e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1622  amine oxidase  39.52 
 
 
443 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2840  amine oxidase  40.09 
 
 
437 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.167776  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0728  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 
570 aa  267  4e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0404381  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1890  amine oxidase  36.93 
 
 
433 aa  265  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1971  amine oxidase  34.45 
 
 
462 aa  265  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3930  hypothetical protein  39.45 
 
 
437 aa  265  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.562242 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1802  FAD dependent oxidoreductase  38.97 
 
 
457 aa  263  8.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000561447 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0367  amine oxidase  38.81 
 
 
434 aa  262  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1328  hypothetical protein  36.32 
 
 
423 aa  262  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0490  amine oxidase:FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 
439 aa  262  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.599363  normal  0.908175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1443  amine oxidase  39.04 
 
 
443 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0739  hypothetical protein  34.22 
 
 
570 aa  255  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1867  amine oxidase  38.07 
 
 
425 aa  254  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4020  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 
430 aa  252  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2754  amine oxidase  37.77 
 
 
430 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1176  amine oxidase  31.05 
 
 
577 aa  244  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1091  putative cyclopropane/cyclopropene fatty acid synthesis protein, flavin amine oxidase  37.77 
 
 
430 aa  243  7e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2937  FAD dependent oxidoreductase  37.53 
 
 
430 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187359  normal  0.0531334 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2019  predicted protein  36.2 
 
 
877 aa  240  5e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0204163 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0414  FAD dependent oxidoreductase  37.72 
 
 
443 aa  239  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308842  normal  0.291599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>