More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4517 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4517  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
196 aa  390  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113878  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  50.57 
 
 
453 aa  150  8.999999999999999e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  49.71 
 
 
158 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  50.55 
 
 
171 aa  148  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  48.65 
 
 
186 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  48.55 
 
 
152 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  44.51 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  43.27 
 
 
160 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  43.27 
 
 
160 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  43.27 
 
 
160 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  46.78 
 
 
160 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  43.27 
 
 
160 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  43.86 
 
 
175 aa  125  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  46.59 
 
 
160 aa  125  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  45.4 
 
 
174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  43.35 
 
 
171 aa  122  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  42.77 
 
 
154 aa  121  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  42.11 
 
 
160 aa  121  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  38.6 
 
 
163 aa  121  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  37.85 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  42.26 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  40.11 
 
 
161 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  40.57 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.43 
 
 
164 aa  118  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  44.94 
 
 
162 aa  118  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  41.76 
 
 
154 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  42.35 
 
 
154 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  42.35 
 
 
154 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  40.11 
 
 
175 aa  114  8.999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  42.35 
 
 
154 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  41.95 
 
 
162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 
166 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  39.56 
 
 
182 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00340  protein-tyrosine-phosphatase  42.02 
 
 
188 aa  111  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.662786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  40.94 
 
 
159 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  43.35 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.48 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.48 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  41.76 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2713  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
155 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.48 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.48 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  43.02 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  41.18 
 
 
154 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  36.63 
 
 
157 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  40.12 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  37.71 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.48 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.48 
 
 
159 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.48 
 
 
159 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  36.42 
 
 
173 aa  107  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  32.2 
 
 
162 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  36.42 
 
 
165 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3711  protein tyrosine phosphatase  41.32 
 
 
187 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.742197  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  41.21 
 
 
154 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12263  phosphotyrosine protein phosphatase ptpA  44.38 
 
 
163 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0875  protein tyrosine phosphatase  42.44 
 
 
152 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.897131  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  40.7 
 
 
159 aa  106  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  33.53 
 
 
161 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  39.76 
 
 
154 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  34.12 
 
 
157 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  34.48 
 
 
157 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  36.9 
 
 
165 aa  105  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.1 
 
 
159 aa  105  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  36.99 
 
 
165 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.27 
 
 
154 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2721  protein-tyrosine-phosphatase (low molecular weight phosphotyrosine protein)  33.14 
 
 
160 aa  104  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0625929  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  37.57 
 
 
159 aa  104  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2888  protein tyrosine phosphatase  39.76 
 
 
164 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0779863  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  39.77 
 
 
163 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  39.18 
 
 
149 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  34.71 
 
 
150 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
162 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  33.72 
 
 
156 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  35.84 
 
 
165 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  33.92 
 
 
157 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2154  protein tyrosine phosphatase  34.48 
 
 
158 aa  102  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.657607  normal  0.32914 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  35.03 
 
 
166 aa  102  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2962  protein tyrosine phosphatase  36.05 
 
 
159 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.502384 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3156  protein tyrosine phosphatase  36.05 
 
 
159 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3358  protein tyrosine phosphatase  38.36 
 
 
165 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603407  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  39.88 
 
 
158 aa  101  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18001  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.56 
 
 
157 aa  101  6e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.756832  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3347  protein tyrosine phosphatase  38.36 
 
 
165 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3409  protein tyrosine phosphatase  38.36 
 
 
165 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198502  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.68 
 
 
160 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3622  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27551  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  37.57 
 
 
159 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10570  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01880)  34.9 
 
 
252 aa  99.4  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836007  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5051  protein tyrosine phosphatase  38.76 
 
 
165 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02921  hypothetical protein  35.71 
 
 
149 aa  99  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17781  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.55 
 
 
157 aa  99  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.214222  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  36.84 
 
 
163 aa  99  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  40.48 
 
 
155 aa  99  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0387  protein tyrosine phosphatase  31.49 
 
 
172 aa  98.6  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.21 
 
 
159 aa  98.2  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32.95 
 
 
154 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 
164 aa  98.2  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  32.95 
 
 
154 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>