More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4389 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  871    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  36.47 
 
 		 477 aa  317  2e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  42.3 
 
 		 497 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  37.13 
 
 		 483 aa  282  7.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  35.1 
 
 		 494 aa  280  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  34.85 
 
 		 487 aa  279  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  36.9 
 
 		 493 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  36.9 
 
 		 493 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  36.99 
 
 		 493 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  36.61 
 
 		 491 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  38.1 
 
 		 489 aa  261  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  38.68 
 
 		 549 aa  256  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  36.22 
 
 		 493 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  36.38 
 
 		 507 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  36.38 
 
 		 507 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  35.89 
 
 		 510 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  36.13 
 
 		 490 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  31.52 
 
 		 508 aa  226  6e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02790  vacuole protein, putative  28.75 
 
 		 591 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  29.07 
 
 		 465 aa  177  4e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02910  Gly-X carboxypeptidase, putative  26.38 
 
 		 573 aa  168  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01640  conserved hypothetical protein  28.19 
 
 		 660 aa  159  7e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  28.09 
 
 		 478 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34371  Gly-X carboxypeptidase  24.34 
 
 		 582 aa  144  4e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04480  carboxypeptidase s precursor, putative  26.37 
 
 		 587 aa  143  6e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0506615  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10986  conserved hypothetical protein  27.11 
 
 		 564 aa  143  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000148304  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04810  vacuolar carboxypeptidase Cps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07040)  27.54 
 
 		 581 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0953418  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  25.58 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  25.84 
 
 		 485 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  29.44 
 
 		 434 aa  122  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  27.61 
 
 		 473 aa  119  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  30.95 
 
 		 494 aa  119  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  30.45 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  28.42 
 
 		 444 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  28.26 
 
 		 449 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06270  carboxypeptidase s precursor, putative  26.08 
 
 		 602 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  30.65 
 
 		 421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  27.53 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  28.61 
 
 		 435 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  27.53 
 
 		 468 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  30.43 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  29.37 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  29.21 
 
 		 429 aa  107  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  27.78 
 
 		 433 aa  106  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  29.02 
 
 		 468 aa  106  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  25.38 
 
 		 442 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28659  predicted protein  23.56 
 
 		 600 aa  103  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  29.35 
 
 		 432 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  28.24 
 
 		 452 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  29.2 
 
 		 445 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  26.77 
 
 		 442 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  28.24 
 
 		 446 aa  102  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  28.24 
 
 		 462 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  25.93 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  28.42 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  25.93 
 
 		 444 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  28.26 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  25.93 
 
 		 444 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  27.82 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  28.08 
 
 		 441 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  27.88 
 
 		 439 aa  101  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  25.5 
 
 		 448 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  26.28 
 
 		 467 aa  100  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  28.61 
 
 		 440 aa  100  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  26.54 
 
 		 476 aa  100  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  27.59 
 
 		 430 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  27.88 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  28.46 
 
 		 439 aa  98.2  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  29.92 
 
 		 434 aa  96.7  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  29.72 
 
 		 442 aa  96.3  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  26.68 
 
 		 450 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  27.39 
 
 		 440 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  28.21 
 
 		 451 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  27.82 
 
 		 451 aa  94  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.27 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  28.38 
 
 		 468 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  25.91 
 
 		 472 aa  91.3  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  27.75 
 
 		 442 aa  90.1  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.61 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  28.31 
 
 		 434 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  24.81 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.87 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0449  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.11 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.408478 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  24.93 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  24.41 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4562  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.16 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  26.04 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  32.67 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  32.41 
 
 		 465 aa  77  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  23.77 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  22.83 
 
 		 485 aa  74.7  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  36.71 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  23.18 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  30.87 
 
 		 465 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  36.08 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  36.48 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  25.29 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3116  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.74 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.210379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.38 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  27.66 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>