More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4375 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4375  cytochrome P450  100 
 
 
464 aa  937    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000475823  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10332  cytochrome P450 135A1 cyp135A1  52.79 
 
 
449 aa  444  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22260  cytochrome P450  53.36 
 
 
451 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140076  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1038  cytochrome P450  43.09 
 
 
459 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0781  cytochrome P450  42.79 
 
 
447 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.620196  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0785  cytochrome P450  42.56 
 
 
447 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0800  cytochrome P450  42.56 
 
 
447 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2644  cytochrome P450  43.07 
 
 
448 aa  297  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.111659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3132  cytochrome P450  44.5 
 
 
444 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10578  cytochrome P450 135B1 cyp135B1  41.74 
 
 
472 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0202  cytochrome P450  40.04 
 
 
462 aa  263  4.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0181  cytochrome P450  35.63 
 
 
457 aa  256  5e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000068031  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  33.19 
 
 
455 aa  253  4.0000000000000004e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3752  cytochrome P450  36.53 
 
 
481 aa  253  6e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1367  cytochrome P450  36.12 
 
 
455 aa  249  5e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0355  cytochrome P450  37.84 
 
 
460 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.06802  normal  0.110441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  33.78 
 
 
463 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  34.81 
 
 
459 aa  246  6.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4026  cytochrome P450  36.53 
 
 
468 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0401  cytochrome P450  36.55 
 
 
448 aa  242  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0394038 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13716  cytochrome P450 137 cyp137  38.12 
 
 
476 aa  241  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  35.48 
 
 
453 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  33.96 
 
 
462 aa  236  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1981  cytochrome P450  33.49 
 
 
468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0150704  normal  0.856547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5162  cytochrome P450  33.55 
 
 
445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000604347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  34.65 
 
 
455 aa  234  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  34.69 
 
 
454 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  34.69 
 
 
454 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3108  cytochrome P450  33.94 
 
 
454 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  32.85 
 
 
467 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0675  cytochrome P450  36.34 
 
 
453 aa  222  9e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  32.93 
 
 
473 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  35.11 
 
 
440 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  32.93 
 
 
473 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3376  cytochrome P450  33.49 
 
 
455 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591253  normal  0.444181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1413  cytochrome P450  34.76 
 
 
490 aa  217  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1104  cytochrome P450  33.96 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1697  cytochrome P450  30.6 
 
 
447 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1722  cytochrome P450  30.77 
 
 
447 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0675089  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5472  cytochrome P450  32.33 
 
 
449 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5093  cytochrome P450  32.56 
 
 
449 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5181  cytochrome P450  32.56 
 
 
449 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3364  cytochrome P450  34.81 
 
 
440 aa  206  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0937489  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1356  cytochrome P450  31.77 
 
 
457 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  36.32 
 
 
450 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1386  cytochrome P450  31.85 
 
 
457 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4677  cytochrome P450  33.17 
 
 
480 aa  202  8e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10137  cytochrome P450 138 cyp138  32.87 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  35.79 
 
 
450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  35.79 
 
 
450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5712  cytochrome P450  33.26 
 
 
450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119413  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5591  cytochrome P450  31.09 
 
 
429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.362948  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3119  cytochrome P450  28.61 
 
 
444 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0220264  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  32.05 
 
 
479 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2973  cytochrome P450  30.6 
 
 
467 aa  152  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0248286  hitchhiker  0.0000662302 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  30.56 
 
 
466 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08350  cytochrome P450  34.53 
 
 
416 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3709  cytochrome P450 CYP110H1  32.58 
 
 
442 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.275139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  32.03 
 
 
447 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  29.05 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  28.47 
 
 
448 aa  147  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  28.13 
 
 
444 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  29.6 
 
 
474 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  31.82 
 
 
489 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  29.15 
 
 
484 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  28.01 
 
 
459 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  31.09 
 
 
446 aa  137  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  29.68 
 
 
452 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  27.63 
 
 
454 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  29.95 
 
 
445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  28.87 
 
 
431 aa  134  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  28.01 
 
 
473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  28.64 
 
 
445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  25.38 
 
 
448 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  28.91 
 
 
452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  31.9 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  27.1 
 
 
470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  25.45 
 
 
441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  28.21 
 
 
463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  31.69 
 
 
464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  27.34 
 
 
433 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  32.2 
 
 
470 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  31.38 
 
 
461 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4119  cytochrome P450  29.21 
 
 
429 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  31.33 
 
 
462 aa  126  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  28.69 
 
 
492 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  26.42 
 
 
1373 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  26.4 
 
 
1373 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  29.93 
 
 
470 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  25.12 
 
 
458 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  28.41 
 
 
492 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  26.4 
 
 
1373 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19470  cytochrome P450  29.84 
 
 
441 aa  124  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0708378  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  26.4 
 
 
1373 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  26.4 
 
 
1373 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  26.4 
 
 
1373 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  26.4 
 
 
1373 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  26.4 
 
 
1380 aa  123  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  32.72 
 
 
462 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  27.4 
 
 
439 aa  123  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>