165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4364 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4364  aspartate racemase  100 
 
 		 305 aa  606  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3120  aspartate racemase family protein  44.3 
 
 		 231 aa  231  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.755099  hitchhiker  0.0000148082 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2205  aspartate racemase family protein  44.74 
 
 		 230 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2335  aspartate racemase family protein  44.05 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0550  aspartate racemase  48.03 
 
 		 230 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2048  aspartate racemase  43.42 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00935047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2253  aspartate racemase family protein  43.86 
 
 		 232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.159416  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2007  aspartate racemase  44.74 
 
 		 232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2251  aspartate racemase family protein  44.74 
 
 		 232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.85155e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2067  aspartate racemase family protein  44.3 
 
 		 235 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2223  aspartate racemase family protein  44.3 
 
 		 235 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2006  aspartate racemase  44.3 
 
 		 232 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.975999  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3727  aspartate racemase  47.88 
 
 		 243 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1062  aspartate racemase  47.16 
 
 		 229 aa  215  9e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301738  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1262  aspartate racemase  44.74 
 
 		 231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.399281  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0941  aspartate racemase  44.78 
 
 		 230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1412  aspartate racemase family protein  44.98 
 
 		 230 aa  211  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193401  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2728  hypothetical protein  46.52 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.881231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0370  aspartate racemase family protein  44.98 
 
 		 231 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000827408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1521  aspartate racemase  44.98 
 
 		 231 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00121722  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3053  aspartate racemase  52.4 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2098  aspartate racemase  43.67 
 
 		 229 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.817779 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3286  putative racemase  46.96 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.989342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0199  aspartate racemase  48.7 
 
 		 239 aa  209  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134945  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1157  aspartate racemase  48.25 
 
 		 230 aa  209  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4503  aspartate racemase  48.9 
 
 		 238 aa  208  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1530  aspartate racemase  45.69 
 
 		 232 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.204202 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2180  aspartate racemase  47.81 
 
 		 230 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2599  aspartate racemase  45.85 
 
 		 232 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577714  normal  0.0780411 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2987  putative racemase  46.09 
 
 		 230 aa  206  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0674464 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5449  aspartate racemase  46.93 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000098  aspartate racemase  41.92 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.220289  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4559  aspartate racemase  44.78 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.110424  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1127  aspartate racemase  47.81 
 
 		 230 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.10247  normal  0.372995 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2053  aspartate racemase  47.37 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5934  aspartate racemase  46.93 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2143  aspartate racemase  46.93 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578734  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02688  predicted racemase  45.22 
 
 		 230 aa  202  8e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3023  putative racemase  45.22 
 
 		 230 aa  202  8e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02649  hypothetical protein  45.22 
 
 		 230 aa  202  8e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2987  putative racemase  45.22 
 
 		 230 aa  202  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3160  putative racemase  45.22 
 
 		 230 aa  202  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4108  putative racemase  45.22 
 
 		 230 aa  202  8e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000397336 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0875  putative racemase  45.22 
 
 		 230 aa  202  8e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2977  aspartate racemase  44.26 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1897  aspartate racemase  44.35 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1147  aspartate racemase  46.61 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2161  aspartate racemase  46.05 
 
 		 230 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.779512  normal  0.822901 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2793  aspartate racemase  46.82 
 
 		 230 aa  200  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3685  aspartate racemase  41.92 
 
 		 233 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.209881 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0021  aspartate racemase  41.74 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1249  aspartate racemase  45.92 
 
 		 239 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0902  aspartate racemase  47.81 
 
 		 233 aa  198  9e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.311636 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0850  aspartate racemase  44.78 
 
 		 230 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0080  aspartate racemase, putative  36.82 
 
 		 231 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.28039  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0120  aspartate racemase, putative  36.82 
 
 		 231 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3231  putative racemase  45.45 
 
 		 235 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000134766 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3347  putative racemase  45.45 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.042763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2506  aspartate racemase  43.16 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4593  aspartate racemase  41.92 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243748  normal  0.631 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3183  putative racemase  45.45 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4072  aspartate racemase  48.48 
 
 		 233 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280676  normal  0.78132 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3246  putative racemase  45.45 
 
 		 235 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000445722 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0351  aspartate racemase  48.25 
 
 		 230 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1908  aspartate racemase  43.67 
 
 		 231 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3165  putative racemase  45.45 
 
 		 235 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03998  aspartate racemase  40.87 
 
 		 232 aa  193  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0092  putative aspartate racemase  36.82 
 
 		 231 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1171  aspartate racemase  43.64 
 
 		 235 aa  192  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000110091  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4003  putative aspartate racemase  45 
 
 		 242 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2886  hypothetical protein  42.86 
 
 		 225 aa  192  8e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1375  aspartate racemase  44.4 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0918  aspartate racemase  42.79 
 
 		 230 aa  191  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.468864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3160  aspartate racemase  43.64 
 
 		 236 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000632506  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1412  aspartate racemase  37.72 
 
 		 229 aa  189  5e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4055  aspartate racemase  43.23 
 
 		 229 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2760  aspartate racemase  42.11 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458115  normal  0.682156 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3409  aspartate racemase  49.55 
 
 		 230 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1970  aspartate racemase  42.98 
 
 		 239 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4003  aspartate racemase  37.78 
 
 		 231 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000429712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0005  aspartate racemase  41.38 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0053  aspartate racemase  37.39 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2649  aspartate racemase  50.21 
 
 		 232 aa  176  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137058  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1847  aspartate racemase  41.23 
 
 		 230 aa  176  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.20632  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6429  aspartate racemase  37.61 
 
 		 234 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.390115 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1082  aspartate racemase  40.91 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2422  aspartate racemase  34.8 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00910723  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0734  aspartate racemase  36.61 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000319838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2459  aspartate racemase family protein  34.8 
 
 		 226 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0713108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2639  aspartate racemase family protein  34.8 
 
 		 226 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2706  aspartate racemase family protein  34.36 
 
 		 226 aa  168  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2656  aspartate racemase family protein  34.36 
 
 		 226 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000254701 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2661  aspartate racemase family protein  33.92 
 
 		 226 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.561952  hitchhiker  0.0000201094 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0972  aspartate racemase  40.81 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2501  aspartate racemase  33.92 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00208009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2665  aspartate racemase family protein  33.92 
 
 		 226 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1877  aspartate racemase  35.68 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211864  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1380  aspartate racemase  39.74 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2383  aspartate racemase  33.92 
 
 		 226 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135854  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2663  aspartate racemase family protein  33.92 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>