More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4361 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4361  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
396 aa  794    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  53.79 
 
 
387 aa  389  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0527  chaperone protein DnaJ  55.19 
 
 
396 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  53.35 
 
 
380 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  54.12 
 
 
383 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  52.21 
 
 
374 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0115  chaperone protein DnaJ  53.19 
 
 
390 aa  364  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0114  chaperone protein DnaJ  52.25 
 
 
391 aa  360  3e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000234642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4268  chaperone protein DnaJ  50.65 
 
 
400 aa  350  3e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5469  chaperone protein DnaJ  52.13 
 
 
387 aa  345  8e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  51.7 
 
 
404 aa  345  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38560  chaperone protein DnaJ  52.22 
 
 
387 aa  333  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0413563  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0258  chaperone protein DnaJ  50.52 
 
 
394 aa  331  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0411969  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0451  chaperone protein DnaJ  52.16 
 
 
392 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0464  chaperone protein DnaJ  52.16 
 
 
392 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0475  chaperone protein DnaJ  52.16 
 
 
392 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0636  chaperone protein DnaJ  50.54 
 
 
393 aa  323  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.37318  normal  0.150619 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5216  chaperone protein DnaJ  53.49 
 
 
404 aa  315  7e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0364  chaperone protein DnaJ  49.74 
 
 
389 aa  315  7e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154064  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6947  chaperone protein DnaJ  49.62 
 
 
398 aa  314  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10357  chaperone protein DnaJ  51.48 
 
 
395 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0119746  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1962  chaperone protein DnaJ  45.99 
 
 
361 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  44.56 
 
 
373 aa  295  9e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0231  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.29 
 
 
393 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208592  normal  0.303974 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  43.77 
 
 
376 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  43.77 
 
 
376 aa  280  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  43.77 
 
 
376 aa  280  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  43.77 
 
 
376 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  43.77 
 
 
376 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  43.77 
 
 
376 aa  280  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  43.77 
 
 
376 aa  280  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  43.5 
 
 
376 aa  279  5e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  43.5 
 
 
376 aa  279  7e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  41.8 
 
 
378 aa  277  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  41.8 
 
 
378 aa  277  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  41.49 
 
 
379 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  41.49 
 
 
379 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  41.49 
 
 
379 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  41.49 
 
 
379 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  41.49 
 
 
379 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  41.36 
 
 
381 aa  275  9e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  41.76 
 
 
375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  42.82 
 
 
382 aa  273  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  41.22 
 
 
377 aa  272  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0800  chaperone protein DnaJ  43.3 
 
 
378 aa  272  9e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  41.22 
 
 
379 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  41.22 
 
 
379 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  41.22 
 
 
379 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  40.11 
 
 
376 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  40.48 
 
 
374 aa  270  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  40.64 
 
 
376 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  40.64 
 
 
376 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  40.64 
 
 
376 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  40.64 
 
 
376 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  40.64 
 
 
376 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  40.64 
 
 
376 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  40.64 
 
 
376 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  40.69 
 
 
377 aa  268  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  40.21 
 
 
377 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0979  chaperone DnaJ-like  41.18 
 
 
401 aa  266  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109475 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  40.37 
 
 
376 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0823  chaperone protein DnaJ  39.24 
 
 
388 aa  266  7e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  40.21 
 
 
389 aa  265  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  39.63 
 
 
378 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  39.63 
 
 
378 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  39.63 
 
 
378 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  39.63 
 
 
378 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  39.63 
 
 
378 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4354  chaperone DnaJ-like  45.79 
 
 
396 aa  264  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0707  chaperone protein DnaJ  40.53 
 
 
383 aa  264  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000115136  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  39.63 
 
 
372 aa  263  4e-69  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  39.36 
 
 
378 aa  262  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  40.27 
 
 
379 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  39.79 
 
 
375 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  39.41 
 
 
377 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4805  chaperone protein DnaJ  58.51 
 
 
406 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  40.36 
 
 
375 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  39.36 
 
 
380 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  39.63 
 
 
376 aa  259  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  40.69 
 
 
374 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  40.36 
 
 
377 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  41.07 
 
 
397 aa  259  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
380 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  40.43 
 
 
374 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  40.43 
 
 
374 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  40.27 
 
 
379 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  40.87 
 
 
377 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  41.06 
 
 
379 aa  257  3e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
385 aa  255  8e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  39.3 
 
 
380 aa  255  8e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  38.26 
 
 
373 aa  255  9e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  39.52 
 
 
381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  40.27 
 
 
378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  41.87 
 
 
384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  40.11 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  40.87 
 
 
375 aa  253  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  38.01 
 
 
379 aa  253  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  40.62 
 
 
377 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  37.63 
 
 
374 aa  253  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  38.01 
 
 
379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>