More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4349 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 493 aa  968    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  64.02 
 
 		 512 aa  597  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  61.88 
 
 		 509 aa  556  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  58.16 
 
 		 511 aa  540  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.16 
 
 		 646 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.37 
 
 		 646 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.37 
 
 		 646 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  56.13 
 
 		 505 aa  524  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.54 
 
 		 609 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.16 
 
 		 627 aa  514  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  55.81 
 
 		 579 aa  509  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.28 
 
 		 521 aa  476  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  59.22 
 
 		 494 aa  468  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.28 
 
 		 504 aa  433  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.95 
 
 		 534 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.23 
 
 		 546 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.49 
 
 		 540 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2622  major facilitator superfamily MFS_1  43.51 
 
 		 790 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.69 
 
 		 579 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.73 
 
 		 522 aa  257  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.6 
 
 		 478 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.03 
 
 		 528 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.55 
 
 		 529 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.92 
 
 		 488 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.86 
 
 		 522 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.77 
 
 		 498 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  34.97 
 
 		 530 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
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NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.8 
 
 		 545 aa  221  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.18 
 
 		 521 aa  217  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.06 
 
 		 480 aa  216  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.17 
 
 		 504 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 485 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 503 aa  213  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 520 aa  212  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 		 477 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.45 
 
 		 489 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  36.1 
 
 		 469 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.99 
 
 		 532 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.56 
 
 		 524 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.4 
 
 		 527 aa  206  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.29 
 
 		 522 aa  206  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.44 
 
 		 488 aa  206  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0761  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.22 
 
 		 534 aa  206  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.698382  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.7 
 
 		 558 aa  206  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.67 
 
 		 520 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.17 
 
 		 520 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.67 
 
 		 520 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.67 
 
 		 520 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.11 
 
 		 510 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 520 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.42 
 
 		 520 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.42 
 
 		 520 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.11 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 520 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 		 480 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.96 
 
 		 478 aa  203  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 555 aa  204  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.65 
 
 		 508 aa  203  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.87 
 
 		 517 aa  202  8e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 		 564 aa  202  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.07 
 
 		 579 aa  202  9e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.9 
 
 		 489 aa  202  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.16 
 
 		 626 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.41 
 
 		 484 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.54 
 
 		 471 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  31.7 
 
 		 480 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 		 530 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.41 
 
 		 478 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.18 
 
 		 529 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 		 520 aa  201  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.18 
 
 		 529 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  32.84 
 
 		 467 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.16 
 
 		 478 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.78 
 
 		 520 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.78 
 
 		 520 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.27 
 
 		 532 aa  199  9e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.05 
 
 		 541 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 		 520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.5 
 
 		 520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
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NC_007650  BTH_II1077  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 523 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0476678  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1879  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 523 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000219002  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  31.45 
 
 		 462 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.82 
 
 		 513 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.34 
 
 		 520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A1947  multidrug ABC transporter, permease  28.71 
 
 		 582 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128457  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.85 
 
 		 514 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  29.61 
 
 		 513 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  29.61 
 
 		 513 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.61 
 
 		 513 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.27 
 
 		 502 aa  197  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 		 492 aa  197  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_0484  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.4 
 
 		 551 aa  197  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.39 
 
 		 513 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.39 
 
 		 513 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.3 
 
 		 504 aa  196  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 		 504 aa  196  7e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_1670  multidrug resistance protein B  28.43 
 
 		 582 aa  196  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11549  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.09 
 
 		 468 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
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