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for query gene Noca_4327 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 182 aa  363  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 184 aa  134  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 188 aa  121  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  37.22 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 214 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 184 aa  110  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  38.33 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 192 aa  101  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 196 aa  97.1  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 199 aa  97.1  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 189 aa  95.9  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 213 aa  95.5  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 201 aa  95.1  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 199 aa  94.4  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 184 aa  91.7  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 183 aa  91.3  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 217 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  47.12 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  40.97 
 
 		 208 aa  87.8  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  32.78 
 
 		 197 aa  87  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
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NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 259 aa  87  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
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NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
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NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  56.16 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  30.56 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
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NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
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NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 204 aa  80.9  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  38.52 
 
 		 209 aa  77.8  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 193 aa  77.4  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  55.84 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  30.81 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 299 aa  74.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  30.98 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  35.9 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  55.26 
 
 		 181 aa  72  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 309 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  33.14 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  32.39 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
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NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
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NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
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NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
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NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
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NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
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