More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4307 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  100 
 
 		 309 aa  608  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  76.95 
 
 		 311 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  77.35 
 
 		 311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  77.6 
 
 		 311 aa  443  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  79.87 
 
 		 311 aa  440  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  72.55 
 
 		 311 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0952  cysteine synthase  75 
 
 		 311 aa  422  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.820864  normal  0.859633 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1111  cysteine synthase A  75.32 
 
 		 311 aa  419  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0492008  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  70.23 
 
 		 309 aa  412  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  70.92 
 
 		 311 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  70.23 
 
 		 309 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  67.74 
 
 		 310 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  66.45 
 
 		 310 aa  387  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  70.32 
 
 		 311 aa  390  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  66.23 
 
 		 309 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  69.51 
 
 		 309 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  63.9 
 
 		 319 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  61.11 
 
 		 311 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09450  cysteine synthase  64.38 
 
 		 311 aa  368  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  65.59 
 
 		 320 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  63.02 
 
 		 330 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  62.94 
 
 		 313 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  66.88 
 
 		 310 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  62.5 
 
 		 320 aa  366  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  62.06 
 
 		 320 aa  364  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  62.42 
 
 		 309 aa  363  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  61.74 
 
 		 320 aa  362  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  61.81 
 
 		 320 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  66.78 
 
 		 309 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  63.75 
 
 		 322 aa  360  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  62.06 
 
 		 323 aa  359  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  63.31 
 
 		 310 aa  358  6e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  62.21 
 
 		 309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  64.72 
 
 		 322 aa  355  5.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  60.13 
 
 		 309 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  60.13 
 
 		 309 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  63.67 
 
 		 321 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  60.93 
 
 		 311 aa  352  5.9999999999999994e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  59.48 
 
 		 309 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  61.97 
 
 		 308 aa  351  8e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  59.42 
 
 		 320 aa  350  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  61.84 
 
 		 308 aa  351  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  60.19 
 
 		 328 aa  350  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  55.59 
 
 		 312 aa  349  4e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  56.44 
 
 		 312 aa  348  5e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  64.82 
 
 		 309 aa  348  8e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  61.44 
 
 		 311 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  60.52 
 
 		 329 aa  345  5e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  60.78 
 
 		 308 aa  345  5e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  61.11 
 
 		 311 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  64.82 
 
 		 309 aa  345  6e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  62.78 
 
 		 320 aa  345  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  63.11 
 
 		 320 aa  345  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  62.09 
 
 		 316 aa  344  8e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  61.31 
 
 		 308 aa  344  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  60.13 
 
 		 317 aa  343  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  60.59 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  56.15 
 
 		 310 aa  342  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  62.3 
 
 		 309 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  59.61 
 
 		 339 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  57.57 
 
 		 308 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  60.71 
 
 		 327 aa  342  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  56.17 
 
 		 311 aa  342  5e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  56.58 
 
 		 311 aa  342  5.999999999999999e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  58.17 
 
 		 327 aa  341  7e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  58.18 
 
 		 324 aa  341  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  62.26 
 
 		 310 aa  340  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0433  cysteine synthase A  62.7 
 
 		 320 aa  340  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0444  cysteine synthase A  62.7 
 
 		 320 aa  340  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00894315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  61.36 
 
 		 311 aa  340  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  59.48 
 
 		 317 aa  339  4e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  54.15 
 
 		 310 aa  338  5.9999999999999996e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  54.15 
 
 		 310 aa  338  5.9999999999999996e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  60.98 
 
 		 309 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  53.92 
 
 		 307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  58.96 
 
 		 310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  62.14 
 
 		 328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  61.44 
 
 		 311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0477  cysteine synthase  62.99 
 
 		 332 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  57.05 
 
 		 311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0559  cysteine synthase A  61.49 
 
 		 332 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770107  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  58.44 
 
 		 326 aa  335  7e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  58.44 
 
 		 326 aa  335  7e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1466  cysteine synthase  63.43 
 
 		 334 aa  334  1e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00108529  normal  0.10478 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  60.53 
 
 		 308 aa  334  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  62.09 
 
 		 310 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  59.42 
 
 		 327 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0484  cysteine synthase A  56.29 
 
 		 324 aa  332  6e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.261567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  58.12 
 
 		 325 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  59.61 
 
 		 309 aa  331  8e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  59.48 
 
 		 328 aa  331  9e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1893  cysteine synthase A  62.78 
 
 		 327 aa  329  3e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1015  cysteine synthase A  63.11 
 
 		 328 aa  330  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  59.09 
 
 		 309 aa  329  3e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  57.38 
 
 		 307 aa  329  4e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  59.74 
 
 		 317 aa  329  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  57.14 
 
 		 324 aa  328  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  60.78 
 
 		 314 aa  328  8e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0343  cysteine synthase A  61.69 
 
 		 332 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  58.82 
 
 		 309 aa  326  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>