More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4281 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4281  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
481 aa  974    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000626871  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1328  aldehyde dehydrogenase  59.08 
 
 
483 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447584  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  45.15 
 
 
485 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  44.94 
 
 
481 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  45.89 
 
 
491 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  45.36 
 
 
482 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  42.24 
 
 
485 aa  361  1e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  43.49 
 
 
516 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  41.84 
 
 
479 aa  353  4e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  41.53 
 
 
478 aa  351  1e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  41.32 
 
 
498 aa  348  9e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  40.41 
 
 
497 aa  346  5e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 
503 aa  346  6e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  41.25 
 
 
500 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 
505 aa  336  5e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  42.34 
 
 
482 aa  336  5e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  43.33 
 
 
483 aa  333  3e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  43.37 
 
 
478 aa  332  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  42.15 
 
 
483 aa  330  5.0000000000000004e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  40.51 
 
 
493 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  41.3 
 
 
496 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  38.97 
 
 
498 aa  325  8.000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  40.17 
 
 
480 aa  323  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  40.87 
 
 
477 aa  322  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.97 
 
 
477 aa  322  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  42 
 
 
482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  40.59 
 
 
496 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  41.14 
 
 
475 aa  319  7.999999999999999e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  43.1 
 
 
497 aa  317  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 
480 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.55 
 
 
480 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  38.67 
 
 
482 aa  318  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  41.03 
 
 
498 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
482 aa  315  9e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  40.04 
 
 
477 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  38.17 
 
 
499 aa  312  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  39.92 
 
 
485 aa  311  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  40.42 
 
 
479 aa  311  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  40.62 
 
 
483 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 
485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 
480 aa  310  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  41.94 
 
 
479 aa  310  5e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  38.59 
 
 
477 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  41.44 
 
 
496 aa  309  5.9999999999999995e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  39.63 
 
 
477 aa  309  5.9999999999999995e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  40.12 
 
 
479 aa  309  6.999999999999999e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  39 
 
 
477 aa  309  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  42.17 
 
 
505 aa  309  9e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  37.32 
 
 
498 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  42.8 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  39.2 
 
 
483 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  39.29 
 
 
493 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  41.15 
 
 
478 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  38.3 
 
 
481 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  43.13 
 
 
446 aa  300  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  37.01 
 
 
484 aa  299  6e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  40.91 
 
 
482 aa  297  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  39.83 
 
 
480 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 
480 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  38.36 
 
 
479 aa  297  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  37.32 
 
 
476 aa  296  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  37.47 
 
 
479 aa  296  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  38.96 
 
 
480 aa  296  6e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  38.91 
 
 
493 aa  295  9e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  38.96 
 
 
480 aa  295  9e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  39.25 
 
 
485 aa  295  1e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  39.41 
 
 
478 aa  293  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  38.22 
 
 
482 aa  293  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  37.76 
 
 
480 aa  292  8e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  38.49 
 
 
482 aa  286  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  36.33 
 
 
491 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  36.04 
 
 
486 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  35.86 
 
 
486 aa  283  7.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2125  Aldehyde Dehydrogenase  39.71 
 
 
488 aa  281  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 
478 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  35.71 
 
 
486 aa  279  9e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  35.79 
 
 
484 aa  277  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  35.65 
 
 
487 aa  274  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1471  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.77 
 
 
490 aa  274  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00283478  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4047  Aldehyde Dehydrogenase  40.09 
 
 
468 aa  272  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1561  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.62 
 
 
503 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4196  Aldehyde Dehydrogenase  37.39 
 
 
483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.115052  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4003  aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 
498 aa  267  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  36.34 
 
 
489 aa  266  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  36.2 
 
 
490 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2545  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.33 
 
 
511 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.572579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  38.35 
 
 
488 aa  263  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2714  aldehyde dehydrogenase  37.36 
 
 
482 aa  263  4.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767285  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0904  aldehyde dehydrogenase  38.05 
 
 
486 aa  263  4.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.678584  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3309  betaine aldehyde dehydrogenase  35.95 
 
 
489 aa  263  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  35.08 
 
 
490 aa  263  6e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  35.74 
 
 
489 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4031  aldehyde dehydrogenase  35.45 
 
 
493 aa  262  8e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00301936  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  35.48 
 
 
489 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1591  betaine aldehyde dehydrogenase  36.36 
 
 
489 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0338  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  37.65 
 
 
513 aa  262  8.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6158  betaine aldehyde dehydrogenase  35.33 
 
 
490 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  35.36 
 
 
488 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0958  Betaine-aldehyde dehydrogenase  36.78 
 
 
498 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.448446  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1373  Aldehyde Dehydrogenase  35.66 
 
 
529 aa  261  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.586199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>