More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4157 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  100 
 
 		 299 aa  587  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  54.41 
 
 		 321 aa  271  9e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  52.94 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2488  glycosyl transferase family 2  52.54 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468454  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  48.7 
 
 		 343 aa  239  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0167  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  53.76 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  49.63 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  50.36 
 
 		 334 aa  235  7e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  53.65 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0337  glycosyl transferase family 2  53.02 
 
 		 320 aa  229  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  52.43 
 
 		 312 aa  225  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  47.35 
 
 		 359 aa  223  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3452  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  54.04 
 
 		 318 aa  222  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.0411609 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0338  glycosyl transferase family 2  49.82 
 
 		 324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5332  glycosyl transferase family 2  45.61 
 
 		 329 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  45.94 
 
 		 319 aa  219  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  47.39 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1142  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  41.67 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  42.14 
 
 		 319 aa  216  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  43.31 
 
 		 316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2860  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  44.03 
 
 		 325 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2312  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  41.73 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  43.71 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  43.71 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  43.71 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1165  glycosyl transferase family 2  48.25 
 
 		 302 aa  179  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 		 510 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09131  hypothetical protein  32.8 
 
 		 395 aa  89.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.554848  hitchhiker  0.00082103 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0245  hypothetical protein  32.8 
 
 		 395 aa  89.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06741  hypothetical protein  26.95 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0870482  normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08961  hypothetical protein  26.76 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.359171  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0837  hypothetical protein  31.18 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08941  hypothetical protein  30.65 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10451  hypothetical protein  30.65 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4062  hypothetical protein  31.6 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2607  hypothetical protein  27.15 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166847  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0654  hypothetical protein  31.71 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2244  hypothetical protein  33.33 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 		 522 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0737  hypothetical protein  27.05 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2601  hypothetical protein  29.8 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.625325  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1772  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25.54 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2163  cell wall biogenesis glycosyltransferase  26.46 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.407321  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0507  hypothetical protein  27.78 
 
 		 408 aa  65.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551714  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3045  glycosyltransferase-like protein  32.79 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2567  cell wall biogenesis glycosyltransferase  28.42 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0206766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2574  cell wall biogenesis glycosyltransferase  28.42 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00191842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2581  cell wall biogenesis glycosyltransferase  28.42 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000562395  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2847  hypothetical protein  26.4 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663115  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1195  glycosyltransferase-like protein  32.02 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.809596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  40.68 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  41.05 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1623  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.13 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.64 
 
 		 528 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2603  hypothetical protein  26.84 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3209  hypothetical protein  26.94 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  42.27 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0648  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1821  hypothetical protein  26.46 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117561  normal  0.653656 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02160  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25.26 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409645  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  36.21 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0420  cell wall biogenesis glycosyltransferase  28.12 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.414661  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2340  hypothetical protein  26.26 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1287  cell wall biogenesis glycosyltransferase  32.96 
 
 		 373 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  40.21 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1685  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.908588  hitchhiker  0.00379696 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4142  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  32.2 
 
 		 693 aa  56.2  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1456  glycosyltransferase-like protein  30.54 
 
 		 397 aa  55.8  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.443232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2052  hypothetical protein  24.87 
 
 		 405 aa  55.8  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6919  glycosyl transferase family 2  37.3 
 
 		 241 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000675814  hitchhiker  0.000119796 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0656  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.69 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.737559 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  33.05 
 
 		 238 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  32.9 
 
 		 281 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  34.74 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1890  hypothetical protein  23.86 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116319  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 391 aa  54.3  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1452  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591361 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4442  glycosyl transferase family 2  34.34 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4380  glycosyl transferase family 2  34.34 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 		 226 aa  53.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 307 aa  53.1  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 315 aa  52.8  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  35.65 
 
 		 346 aa  52.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0335  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 476 aa  52.4  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>