More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4111 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 211 aa  430  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  42.44 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 228 aa  131  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 228 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1152  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 242 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 242 aa  108  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 207 aa  84.7  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  29.33 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  23.44 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2525  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  hitchhiker  0.00170542 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2568  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2754  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.864254  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2788  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000644753  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 198 aa  62  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2767  transcriptional regulator, TetR family  21.88 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.430405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2560  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.282393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2809  transcriptional regulator, TetR family  21.54 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167328  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 420 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 497 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  24.26 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  24.26 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2712  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 446 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  36.26 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3518  regulatory protein, TetR  30.6 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640434  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 250 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0246  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330264  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>