More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4109 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4109  dehydratase  100 
 
 
150 aa  303  7e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294085  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1857  MaoC domain protein dehydratase  67.59 
 
 
149 aa  202  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5537  dehydratase, MaoC-like domain-containing protein  39.86 
 
 
157 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4847  dehydratase  39.46 
 
 
164 aa  103  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6290  MaoC domain protein dehydratase  41.18 
 
 
162 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1539  dehydratase  38.73 
 
 
160 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6312  MaoC domain protein dehydratase  40.29 
 
 
157 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4357  MaoC domain protein dehydratase  36.91 
 
 
159 aa  94  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0411099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0232  dehydratase  38.3 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2898  MaoC domain protein dehydratase  33.78 
 
 
152 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 
166 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1191  MaoC-like dehydratase  34.59 
 
 
149 aa  84.3  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1834  MaoC-like dehydratase  31.94 
 
 
171 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.420495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2956  MaoC domain protein dehydratase  39.23 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0031  dehydratase  36.42 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.109273  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0316  dehydratase  38.03 
 
 
148 aa  80.1  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1030  MaoC domain protein dehydratase  32.88 
 
 
157 aa  80.1  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329133  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4972  dehydratase  38.73 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810088  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 
690 aa  78.2  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2272  dehydratase  39.1 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.827774 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  36.18 
 
 
681 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  36.18 
 
 
681 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  35.53 
 
 
683 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  36.13 
 
 
682 aa  77  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3455  MaoC domain protein dehydratase  32.43 
 
 
199 aa  77.4  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.031511  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  36.18 
 
 
681 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  35.53 
 
 
681 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4127  dehydratase  34.75 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  34 
 
 
679 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2549  dehydratase  34.93 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0407782  normal  0.257026 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2915  MaoC domain protein dehydratase  32.39 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.759057  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
684 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  33.77 
 
 
695 aa  73.6  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7491  MaoC-like dehydratase  33.8 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  34.44 
 
 
684 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  33.12 
 
 
686 aa  72  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2642  MaoC-like dehydratase  31.11 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0607  MaoC-like dehydratase  32.59 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  34.44 
 
 
684 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  36.77 
 
 
686 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  34.44 
 
 
684 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2320  MaoC domain protein dehydratase  34.59 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2751  MaoC domain protein dehydratase  34.04 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0495  dehydratase  33.57 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3489  MaoC domain protein dehydratase  32.39 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4505  MaoC-like dehydratase  32.88 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.547822 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0007  MaoC domain protein dehydratase  32.8 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1990  dehydratase  33.33 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  normal  0.551066 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7153  MaoC-like dehydratase  31.11 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851321  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7289  MaoC-like dehydratase  29.63 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2195  MaoC domain protein dehydratase  34.07 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.300893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5038  MaoC domain protein dehydratase  31.11 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0349  MaoC domain protein dehydratase  33.08 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  32.85 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  31.85 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2320  MaoC domain protein dehydratase  32.06 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1872  MaoC domain protein dehydratase  34.07 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.249536 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2124  MaoC domain protein dehydratase  32.64 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000215155  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2043  hypothetical protein  33.82 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.770796  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6129  dehydratase  30.99 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1553  dehydratase  30.82 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6403  dehydratase  33.79 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394709 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4051  dehydratase  40.91 
 
 
140 aa  67  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46056  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3000  MaoC domain-containing protein  32.19 
 
 
151 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0628235  normal  0.0197508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2693  dehydratase  32.19 
 
 
151 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215735  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
683 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1216  dehydratase  31.3 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5510  MaoC domain protein dehydratase  31.03 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.427484 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0832  putative dehydratase  31.13 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0146859 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6022  dehydratase  31.72 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176913  normal  0.447849 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  33.99 
 
 
690 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.21 
 
 
691 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5530  MaoC-like dehydratase  32.41 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3797  dehydratase  31.2 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5894  dehydratase  32.41 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36432  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  32.5 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0980  MaoC-like dehydratase  33.59 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6245  dehydratase  31.72 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3537  MaoC domain-containing protein  34.31 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6530  dehydratase  31.72 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82464  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3435  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4356  MaoC-like dehydratase  32.21 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0584  dehydratase  35.51 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758a  hypothetical protein  32.28 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2254  dehydratase  30.66 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.437437  normal  0.402982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  30.37 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3912  dehydratase  31.78 
 
 
169 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.675333  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1473  dehydratase  33.09 
 
 
172 aa  63.5  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1055  dehydratase  40.37 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4100  MaoC-like domain protein  31.65 
 
 
173 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  34.91 
 
 
836 aa  63.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3292  MaoC-like dehydratase  37.17 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0096  MaoC domain protein dehydratase  34.85 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  31.65 
 
 
156 aa  62  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3467  MaoC-like dehydratase  34.91 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.273532  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3597  dehydratase  39.29 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.43263 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  31.13 
 
 
683 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4375  MaoC domain protein dehydratase  31.67 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3190  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  32.58 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3698  MaoC-related protein  31.88 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.27276  normal  0.530433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>