179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4067 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 468 aa  894    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  56.79 
 
 		 447 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  36.48 
 
 		 456 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  31.98 
 
 		 446 aa  253  6e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  31.44 
 
 		 449 aa  247  4e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  31.51 
 
 		 446 aa  240  5e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  31.76 
 
 		 446 aa  232  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  37.56 
 
 		 481 aa  209  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  36.3 
 
 		 470 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  36.54 
 
 		 470 aa  206  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  33.79 
 
 		 481 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  33.63 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  38.78 
 
 		 456 aa  186  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  37.38 
 
 		 503 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  36.23 
 
 		 503 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  33.18 
 
 		 451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  37.23 
 
 		 503 aa  183  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  35.19 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  34.32 
 
 		 463 aa  177  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  39 
 
 		 457 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  38.55 
 
 		 455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  35.45 
 
 		 461 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  38.44 
 
 		 458 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  32.6 
 
 		 460 aa  172  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  37.54 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  39.42 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  35.6 
 
 		 461 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  35.63 
 
 		 465 aa  170  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  37.75 
 
 		 458 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  33.02 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  34.95 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  34.78 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7945  MmgE/PrpD family protein  38.24 
 
 		 465 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762062  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  34.17 
 
 		 476 aa  167  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  34.53 
 
 		 456 aa  166  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  37.5 
 
 		 458 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  32.74 
 
 		 504 aa  162  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  37.92 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  31.94 
 
 		 468 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  33.09 
 
 		 455 aa  156  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  30.92 
 
 		 488 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  28.28 
 
 		 469 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  30.17 
 
 		 490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  37.16 
 
 		 468 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  33.58 
 
 		 486 aa  151  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  33.9 
 
 		 451 aa  150  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  32.43 
 
 		 485 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  31.22 
 
 		 474 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  28.51 
 
 		 453 aa  146  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  31.63 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  32.48 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  30.09 
 
 		 482 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  35.69 
 
 		 456 aa  144  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  30.19 
 
 		 481 aa  143  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  31.57 
 
 		 457 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  33.98 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  33.51 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  30.75 
 
 		 462 aa  141  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  29.85 
 
 		 501 aa  140  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  30.02 
 
 		 483 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  33.08 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  32.08 
 
 		 451 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  30.38 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  30.84 
 
 		 459 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  31.84 
 
 		 454 aa  133  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  30.3 
 
 		 450 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  29.98 
 
 		 450 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  32.52 
 
 		 461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  30.62 
 
 		 500 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  32.37 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  32.02 
 
 		 454 aa  130  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  31.39 
 
 		 462 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  32.46 
 
 		 450 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  33.12 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  34.73 
 
 		 482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  30.96 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  30.65 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  32.16 
 
 		 463 aa  126  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  32.16 
 
 		 464 aa  126  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  33.58 
 
 		 476 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  28.03 
 
 		 460 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  29.09 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4958  MmgE/PrpD family protein  32.29 
 
 		 464 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  29.66 
 
 		 462 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  34.9 
 
 		 462 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1051  MmgE/PrpD family protein  34.73 
 
 		 449 aa  123  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0583163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  31.38 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  30.64 
 
 		 494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  28.92 
 
 		 449 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  30.33 
 
 		 457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  31.81 
 
 		 464 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  32.6 
 
 		 454 aa  120  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  29.36 
 
 		 491 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  29.36 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  32.16 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  29.36 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  31.4 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  28.95 
 
 		 492 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  27.91 
 
 		 485 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  28.95 
 
 		 492 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>