More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4048 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4048  hypothetical protein  100 
 
 		 556 aa  1088    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  43.66 
 
 		 556 aa  452  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  42.53 
 
 		 565 aa  444  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03381  ABC transporter substrate binding protein  41.79 
 
 		 574 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3756  ABC-1 domain protein  40.15 
 
 		 563 aa  349  9e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.91 
 
 		 554 aa  275  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.08 
 
 		 559 aa  270  5e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.38 
 
 		 559 aa  266  5.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  31.93 
 
 		 558 aa  266  8e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  29.91 
 
 		 558 aa  265  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  34.55 
 
 		 565 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  34.55 
 
 		 565 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  35.26 
 
 		 562 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  32.13 
 
 		 551 aa  261  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  36.12 
 
 		 556 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  34.37 
 
 		 557 aa  257  4e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  32.04 
 
 		 561 aa  257  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  30.26 
 
 		 558 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  29.67 
 
 		 556 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.92 
 
 		 555 aa  251  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  28.77 
 
 		 537 aa  251  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  31.35 
 
 		 562 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  31.35 
 
 		 562 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.6 
 
 		 549 aa  249  8e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  30.94 
 
 		 557 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.65 
 
 		 558 aa  247  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.02 
 
 		 561 aa  246  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  35.1 
 
 		 582 aa  246  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  29.25 
 
 		 561 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  28.47 
 
 		 564 aa  244  3.9999999999999997e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  28.57 
 
 		 537 aa  243  5e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  29.67 
 
 		 559 aa  240  5e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  32.59 
 
 		 560 aa  240  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  32.54 
 
 		 581 aa  240  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.55 
 
 		 559 aa  239  8e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  31.96 
 
 		 547 aa  239  9e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  31.49 
 
 		 582 aa  239  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.71 
 
 		 559 aa  238  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  31.21 
 
 		 563 aa  237  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  32.59 
 
 		 552 aa  236  8e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  27.36 
 
 		 558 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.27 
 
 		 561 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  30.66 
 
 		 585 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  31.8 
 
 		 578 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  31.72 
 
 		 561 aa  235  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  32.39 
 
 		 560 aa  234  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  31.61 
 
 		 565 aa  233  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.19 
 
 		 584 aa  233  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  36.16 
 
 		 544 aa  232  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  30.09 
 
 		 599 aa  233  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  31.91 
 
 		 582 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  30.08 
 
 		 552 aa  231  4e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  32.78 
 
 		 557 aa  229  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  32.2 
 
 		 581 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  31.79 
 
 		 563 aa  228  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  31.76 
 
 		 568 aa  226  9e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  30.82 
 
 		 561 aa  226  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  30.82 
 
 		 584 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  29.34 
 
 		 549 aa  223  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.18 
 
 		 573 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.63 
 
 		 558 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0918  serine/threonine protein kinase  26.18 
 
 		 526 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2256  ABC-1 domain protein  32.42 
 
 		 560 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398282 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1228  unusual protein kinase  27.97 
 
 		 606 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.99408  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  30.93 
 
 		 576 aa  221  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  30.32 
 
 		 549 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  32.69 
 
 		 559 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  30.64 
 
 		 571 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  32.58 
 
 		 550 aa  220  7e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.18 
 
 		 557 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  29.74 
 
 		 549 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2162  kinase  33.97 
 
 		 559 aa  219  8.999999999999998e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  30.4 
 
 		 560 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  33.05 
 
 		 557 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  32.66 
 
 		 560 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5397  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.33 
 
 		 501 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2477  kinase  35.06 
 
 		 550 aa  218  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.312771  normal  0.0435019 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 		 557 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3884  ABC-1 domain protein  36.76 
 
 		 556 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  29.53 
 
 		 549 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  31.89 
 
 		 557 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4100  ABC-1 domain-containing protein  34.63 
 
 		 659 aa  216  5.9999999999999996e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  26.21 
 
 		 558 aa  216  7e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  32.97 
 
 		 583 aa  216  7e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  31.71 
 
 		 582 aa  216  7e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  29.52 
 
 		 555 aa  216  8e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  29.27 
 
 		 547 aa  216  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1043  hypothetical protein  28.07 
 
 		 559 aa  215  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135473  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  30.8 
 
 		 547 aa  214  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1325  hypothetical protein  32.56 
 
 		 619 aa  214  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2415  hypothetical protein  34.06 
 
 		 545 aa  212  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0766121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  30.9 
 
 		 549 aa  212  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  33.01 
 
 		 558 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21981  hypothetical protein  32.3 
 
 		 619 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.544475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10840  predicted unusual protein kinase  29.55 
 
 		 550 aa  211  3e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1211  ABC-1 domain protein  31.16 
 
 		 545 aa  211  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  32.22 
 
 		 566 aa  210  5e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  28.87 
 
 		 591 aa  210  6e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.21 
 
 		 592 aa  210  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19231  hypothetical protein  31.98 
 
 		 618 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.494256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>