More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4047 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  606  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  46.36 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0391  hypothetical protein  50.92 
 
 		 331 aa  242  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  46.08 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.61 
 
 		 340 aa  225  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.8 
 
 		 335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  43.57 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2821  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.2 
 
 		 342 aa  182  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.499218  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.56 
 
 		 356 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  36.92 
 
 		 291 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.65 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.65 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  33.98 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  33.2 
 
 		 287 aa  129  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0112  hypothetical protein  36.75 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  33.98 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  31.65 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  33.33 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  31.29 
 
 		 303 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  34.22 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1368  hypothetical protein  30.99 
 
 		 306 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.496352  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  32.23 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  30.51 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  32.23 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0094  hypothetical protein  28.62 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0098  hypothetical protein  28.62 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  30.5 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  30.5 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  30.5 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  29.83 
 
 		 304 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  31.89 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  30.5 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5832  hypothetical protein  30.77 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.684234 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6058  hypothetical protein  30.67 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 295 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.503688 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2709  EamA family protein  28.57 
 
 		 304 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00270641  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7691  hypothetical protein  30.2 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.84 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4101  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.27 
 
 		 309 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518904  normal  0.0241309 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  31.8 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  28.67 
 
 		 308 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  27.45 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  29.47 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.98 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  32.39 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  27.24 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  26.3 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.48 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  26.3 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  25.93 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  26.67 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  25.93 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  25.93 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  27.17 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  29.01 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  27.17 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  26.49 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.26 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.76 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  27.11 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  28.44 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  28.22 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.15 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.92 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  26.01 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  26.82 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  30.24 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  26.71 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  30.39 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.57 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  28.93 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.4 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.56 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  29.13 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  27.42 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.33 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  26.89 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  28.09 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  28.62 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  24.27 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  27.76 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  26.86 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  30.51 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  26.76 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  26.91 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  24.5 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.9 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  26.69 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  26.32 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  26.35 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.32 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  26.32 
 
 		 283 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  26.94 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>