15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4041 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4041  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  547  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5948  hypothetical protein  37.17 
 
 		 301 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.720935  normal  0.0319733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4393  UbiA prenyltransferase  34.36 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5114  UbiA prenyltransferase  38.06 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20380  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  35.94 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2105  UbiA prenyltransferase  34.76 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.481967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1161  UbiA prenyltransferase  33.77 
 
 		 291 aa  52.4  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.786888  hitchhiker  0.00393924 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00490  hypothetical protein  33.96 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.295551  normal  0.866332 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18930  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  28.8 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.401268  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0148  UbiA prenyltransferase  32.44 
 
 		 258 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  37.68 
 
 		 1888 aa  47.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4697  UbiA prenyltransferase  32.64 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.232584 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  28.45 
 
 		 1281 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0650  UbiA prenyltransferase  47.62 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3992  UbiA prenyltransferase  30.96 
 
 		 273 aa  42.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal  0.560711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>