34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4011 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4011  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  801    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456276  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0782  hypothetical protein  56.31 
 
 		 415 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.540249  normal  0.366312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0915  hypothetical protein  56.68 
 
 		 420 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0673  hypothetical protein  55.19 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.527645  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31730  hypothetical protein  54.31 
 
 		 413 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.872295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2951  hypothetical protein  56.42 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.124646  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2066  hypothetical protein  53.16 
 
 		 413 aa  412  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.465784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03780  hypothetical protein  54.02 
 
 		 423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2685  hypothetical protein  53.02 
 
 		 418 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  0.62203 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1472  lipopolysaccharide kinase  50.9 
 
 		 470 aa  390  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12720  hypothetical protein  52.66 
 
 		 413 aa  388  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.520291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7709  hypothetical protein  51.39 
 
 		 403 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0749  hypothetical protein  49.49 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0866  hypothetical protein  50.13 
 
 		 472 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0084  hypothetical protein  52.66 
 
 		 418 aa  372  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0069  hypothetical protein  50.39 
 
 		 471 aa  363  4e-99  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0105826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0285  hypothetical protein  49.24 
 
 		 421 aa  350  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  normal  0.543149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0244  hypothetical protein  48.48 
 
 		 421 aa  345  8.999999999999999e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0527558  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04000  hypothetical protein  51.85 
 
 		 433 aa  339  5e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4891  hypothetical protein  47.24 
 
 		 446 aa  335  9e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3935  hypothetical protein  46.17 
 
 		 411 aa  303  5.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2498  hypothetical protein  43.37 
 
 		 415 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0464385  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2160  hypothetical protein  40.87 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1789  hypothetical protein  40.36 
 
 		 410 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1718  hypothetical protein  40.36 
 
 		 410 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393628  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5157  hypothetical protein  36.48 
 
 		 412 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.739341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0416  hypothetical protein  39.41 
 
 		 402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875248  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1264  hypothetical protein  40 
 
 		 422 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1247  hypothetical protein  40 
 
 		 422 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1274  hypothetical protein  40 
 
 		 422 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294638  normal  0.591376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2540  hypothetical protein  38.1 
 
 		 420 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3855  hypothetical protein  37.53 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1640  hypothetical protein  36.53 
 
 		 422 aa  192  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.229414  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02451  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  31.54 
 
 		 249 aa  44.3  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>