More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3961 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  100 
 
 
255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  66.67 
 
 
266 aa  340  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  69.23 
 
 
264 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  65.25 
 
 
256 aa  332  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  67.65 
 
 
262 aa  327  9e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  67.1 
 
 
255 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  69.13 
 
 
253 aa  323  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  65.37 
 
 
255 aa  321  6e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  63.93 
 
 
277 aa  320  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  67.1 
 
 
253 aa  318  3.9999999999999996e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  66.53 
 
 
455 aa  317  9e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  72.17 
 
 
258 aa  315  6e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  65.25 
 
 
291 aa  314  7e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  63.71 
 
 
277 aa  314  9e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  62.18 
 
 
258 aa  312  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  65.95 
 
 
256 aa  312  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  67.11 
 
 
445 aa  310  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  63.49 
 
 
247 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  60.08 
 
 
259 aa  305  5.0000000000000004e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  64.29 
 
 
258 aa  305  5.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  64.5 
 
 
261 aa  305  6e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  61.6 
 
 
250 aa  302  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  62.18 
 
 
288 aa  298  7e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.52 
 
 
280 aa  298  7e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  59.18 
 
 
274 aa  297  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  59.41 
 
 
258 aa  296  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  60.26 
 
 
271 aa  295  3e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  62.03 
 
 
264 aa  295  6e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  59.84 
 
 
255 aa  294  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  61.57 
 
 
258 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  61.9 
 
 
268 aa  293  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  65.64 
 
 
257 aa  292  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  56.17 
 
 
263 aa  291  8e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  63.56 
 
 
312 aa  289  3e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  61.6 
 
 
252 aa  287  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  62.5 
 
 
244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  60.78 
 
 
247 aa  282  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  62.4 
 
 
255 aa  282  4.0000000000000003e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  52.79 
 
 
279 aa  279  2e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  58.47 
 
 
245 aa  278  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  61.22 
 
 
302 aa  277  9e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  62.05 
 
 
250 aa  276  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  56.96 
 
 
266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  60.87 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  55.65 
 
 
252 aa  272  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  56.6 
 
 
243 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.72 
 
 
245 aa  270  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  60.09 
 
 
293 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  58.51 
 
 
255 aa  268  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  57.14 
 
 
253 aa  267  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  59.91 
 
 
272 aa  265  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  59.48 
 
 
257 aa  264  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  61.78 
 
 
277 aa  261  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  54.47 
 
 
255 aa  258  8e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  53.19 
 
 
269 aa  255  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  55.6 
 
 
249 aa  255  6e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  58.05 
 
 
241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  55.51 
 
 
279 aa  252  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  59 
 
 
249 aa  250  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  57.47 
 
 
248 aa  247  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  54.98 
 
 
243 aa  244  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  54.67 
 
 
271 aa  242  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  50 
 
 
244 aa  242  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  48.84 
 
 
228 aa  241  9e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.04 
 
 
269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  51.8 
 
 
231 aa  238  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  50.67 
 
 
231 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  54.24 
 
 
247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  48.95 
 
 
279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  47.69 
 
 
227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  58.25 
 
 
224 aa  232  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  47.27 
 
 
229 aa  230  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  49.77 
 
 
229 aa  229  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  49.77 
 
 
229 aa  227  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  46.96 
 
 
240 aa  226  3e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  45.41 
 
 
230 aa  226  3e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  60.17 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  55.51 
 
 
247 aa  224  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  49.78 
 
 
252 aa  223  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  51.11 
 
 
240 aa  222  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  50 
 
 
239 aa  222  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.03 
 
 
230 aa  221  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  46.05 
 
 
227 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  47.91 
 
 
225 aa  218  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  48.11 
 
 
225 aa  217  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  44.05 
 
 
252 aa  216  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  44.05 
 
 
252 aa  216  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 
222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  47.03 
 
 
228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  43.88 
 
 
248 aa  215  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  47.79 
 
 
231 aa  215  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  48.9 
 
 
240 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  49.55 
 
 
228 aa  214  8e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  47.32 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0841  ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.598404  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  46.76 
 
 
235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0119  ABC transporter  42.5 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.393598  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  47.46 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.09 
 
 
227 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0118  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>