More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3942 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  100 
 
 
280 aa  548  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1755  protein serine/threonine phosphatase  49.19 
 
 
284 aa  194  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.959742  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2201  protein serine/threonine phosphatase  46.96 
 
 
296 aa  193  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  decreased coverage  0.00279452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  41.41 
 
 
325 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  41.8 
 
 
323 aa  186  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0489  protein serine/threonine phosphatase  48.15 
 
 
285 aa  183  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.650161  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1325  protein serine/threonine phosphatase  41.91 
 
 
258 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235242  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  43.9 
 
 
452 aa  168  7e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0456  protein serine/threonine phosphatase  41.8 
 
 
287 aa  168  9e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137154  normal  0.894347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0386  protein serine/threonine phosphatase  44.76 
 
 
250 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169531  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  43.57 
 
 
394 aa  167  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 
395 aa  166  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05590  serine/threonine protein phosphatase  46.78 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721089  normal  0.280672 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  41.02 
 
 
425 aa  163  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21560  serine/threonine protein phosphatase  41.56 
 
 
293 aa  160  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146725  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  40.39 
 
 
449 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07530  serine/threonine protein phosphatase  41.95 
 
 
266 aa  155  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.090803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  41.27 
 
 
463 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  44.13 
 
 
479 aa  155  9e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  40.96 
 
 
474 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  36.08 
 
 
554 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  39.92 
 
 
548 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  40.08 
 
 
505 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  42.29 
 
 
463 aa  148  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2294  Phosphoprotein phosphatase  40.24 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.11 
 
 
611 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  39.43 
 
 
421 aa  146  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  42.62 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  40.08 
 
 
597 aa  145  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.51 
 
 
237 aa  145  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  37.25 
 
 
564 aa  145  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  40 
 
 
466 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  42.45 
 
 
519 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  39.51 
 
 
265 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0022  protein serine/threonine phosphatase  42.5 
 
 
511 aa  142  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1928  protein serine/threonine phosphatase  39.84 
 
 
270 aa  142  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0340359  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  37.6 
 
 
540 aa  142  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  38.85 
 
 
500 aa  141  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  35.02 
 
 
574 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  36.4 
 
 
241 aa  139  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  35.18 
 
 
250 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  31.98 
 
 
245 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  38.55 
 
 
507 aa  138  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  41.56 
 
 
267 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  39.27 
 
 
264 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2701  protein serine/threonine phosphatase  40.57 
 
 
256 aa  138  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.312462  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  37.05 
 
 
247 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  29.96 
 
 
241 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.96 
 
 
438 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  35.18 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  35.18 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  35.18 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  35.18 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  38.65 
 
 
538 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  37.64 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  38.65 
 
 
256 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  39.52 
 
 
472 aa  136  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.14 
 
 
482 aa  135  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  40.68 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  34.78 
 
 
250 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  34.78 
 
 
250 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.75 
 
 
239 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  40.68 
 
 
256 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.78 
 
 
470 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  40.68 
 
 
256 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  38.31 
 
 
441 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  39.17 
 
 
467 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  35.57 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.88 
 
 
247 aa  133  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  36.73 
 
 
478 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  35.69 
 
 
313 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  38.52 
 
 
571 aa  132  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  38.91 
 
 
478 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  38.15 
 
 
426 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  34.02 
 
 
241 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  35.18 
 
 
250 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  35.18 
 
 
250 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  40.33 
 
 
252 aa  132  9e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6203  protein serine/threonine phosphatase  38.78 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00400248  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  36 
 
 
567 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  34.23 
 
 
558 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  39.46 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  36.78 
 
 
462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.39 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  32.92 
 
 
238 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  34.17 
 
 
255 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  39.59 
 
 
469 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  37.7 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.27 
 
 
242 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  34.13 
 
 
250 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  35.15 
 
 
519 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  37.55 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  35.71 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  39.52 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.23 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  38.11 
 
 
422 aa  127  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  38.82 
 
 
239 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  37.85 
 
 
416 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  40.8 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  34.44 
 
 
242 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>