More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3896 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  100 
 
 		 93 aa  187  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  78.49 
 
 		 93 aa  154  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  81.72 
 
 		 91 aa  150  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  81.72 
 
 		 91 aa  150  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  80.85 
 
 		 94 aa  148  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  78.02 
 
 		 96 aa  147  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  73.96 
 
 		 96 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04070  SSU ribosomal protein S17P  76.34 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6605  ribosomal protein S17  76.34 
 
 		 93 aa  144  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  76.34 
 
 		 93 aa  144  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  77.42 
 
 		 91 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  78.65 
 
 		 90 aa  143  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  76.34 
 
 		 88 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  82.14 
 
 		 90 aa  141  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  72.83 
 
 		 102 aa  140  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  72 
 
 		 100 aa  140  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  80.95 
 
 		 99 aa  140  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  76.14 
 
 		 98 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23720  SSU ribosomal protein S17P  72.53 
 
 		 108 aa  138  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  74.73 
 
 		 96 aa  136  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6040  30S ribosomal protein S17  75.29 
 
 		 102 aa  136  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216935  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  72.34 
 
 		 101 aa  135  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  75.86 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  75.56 
 
 		 99 aa  133  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3426  30S ribosomal protein S17  67.02 
 
 		 94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  73.81 
 
 		 85 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0697  ribosomal protein S17  69.15 
 
 		 94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  65.96 
 
 		 94 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1132  ribosomal protein S17  68.48 
 
 		 107 aa  126  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17070  SSU ribosomal protein S17P  62.37 
 
 		 93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000664642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  71.08 
 
 		 84 aa  122  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  71.95 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  67.9 
 
 		 88 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  71.08 
 
 		 84 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  61.62 
 
 		 99 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  61.62 
 
 		 99 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  61.62 
 
 		 99 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  69.88 
 
 		 84 aa  121  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  68.67 
 
 		 86 aa  120  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  71.95 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  63.86 
 
 		 84 aa  119  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  65.48 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20780  SSU ribosomal protein S17P  57.84 
 
 		 102 aa  118  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  64.29 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  67.06 
 
 		 86 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  70.24 
 
 		 85 aa  116  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1515  30S ribosomal protein S17  67.47 
 
 		 99 aa  116  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.585165  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  65.85 
 
 		 87 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1314  ribosomal protein S17  65.85 
 
 		 98 aa  114  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5040  ribosomal protein S17  67.07 
 
 		 98 aa  114  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0780546  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  64.63 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  59.14 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  65.06 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 84 aa  111  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  65.06 
 
 		 87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23380  SSU ribosomal protein S17P  62.2 
 
 		 87 aa  110  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000933306 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01260  ribosomal protein S17  69.41 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.693466  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2169  ribosomal protein S17  60 
 
 		 86 aa  107  8.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.277733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 85 aa  107  8.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09910  SSU ribosomal protein S17P  60 
 
 		 86 aa  105  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.024161  hitchhiker  0.00000168853 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0131  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.17978e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0113  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000389804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0119  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000418138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5186  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000132516  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0119  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0115  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.46917e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0113  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0119  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000491132  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  61.18 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1276  ribosomal protein S17  67.86 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0140  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000717207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  62.2 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  60.49 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0150  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0114  30S ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000376744  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4352  30S ribosomal protein S17  61.18 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186006  normal  0.0710567 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3986  ribosomal protein S17  63.86 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  63.86 
 
 		 87 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  56.96 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  69.23 
 
 		 94 aa  103  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1075  30S ribosomal protein S17  54.65 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0116  30S ribosomal protein S17  60.24 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  61.33 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0710  30S ribosomal protein S17  61.25 
 
 		 88 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000605454  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  60.24 
 
 		 86 aa  102  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  57.83 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0700  30S ribosomal protein S17  63.16 
 
 		 81 aa  100  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000459062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 85 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0635  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000424203  hitchhiker  0.0000000101363 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2568  30S ribosomal protein S17  64.47 
 
 		 83 aa  100  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  57.78 
 
 		 99 aa  100  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  56.63 
 
 		 88 aa  100  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  56.63 
 
 		 88 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  56.63 
 
 		 88 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>