More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3893 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  81.28 
 
 		 189 aa  322  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  78.95 
 
 		 191 aa  313  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  78.31 
 
 		 194 aa  310  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  76.14 
 
 		 190 aa  309  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  77.08 
 
 		 191 aa  308  2.9999999999999997e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  76.92 
 
 		 199 aa  306  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  77.96 
 
 		 189 aa  305  3e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5136  ribosomal protein L5  78.69 
 
 		 191 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.429386 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  76.44 
 
 		 192 aa  302  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  78.26 
 
 		 193 aa  301  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  78.09 
 
 		 191 aa  298  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  72.45 
 
 		 189 aa  298  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  77.37 
 
 		 193 aa  298  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  75.27 
 
 		 196 aa  298  5e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  76.06 
 
 		 190 aa  296  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  76.22 
 
 		 187 aa  296  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0700  ribosomal protein L5  80.11 
 
 		 189 aa  295  4e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  76.22 
 
 		 189 aa  292  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  74.73 
 
 		 188 aa  288  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  80.59 
 
 		 184 aa  285  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  72.97 
 
 		 187 aa  283  8e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  73.51 
 
 		 192 aa  282  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1719  50S ribosomal protein L5  70.21 
 
 		 190 aa  278  5e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1135  ribosomal protein L5  75.53 
 
 		 192 aa  277  8e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.738574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3419  ribosomal protein L5  78.92 
 
 		 187 aa  277  9e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264  ribosomal L5P C-terminal domain protein  70.21 
 
 		 190 aa  275  2e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6602  ribosomal protein L5  76.76 
 
 		 187 aa  274  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3911  50S ribosomal protein L5  76.34 
 
 		 189 aa  272  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4303  50S ribosomal protein L5  76.34 
 
 		 189 aa  272  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.434837  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6037  50S ribosomal protein L5  74.73 
 
 		 189 aa  271  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3711  ribosomal protein L5  75.4 
 
 		 192 aa  271  4.0000000000000004e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1056  50S ribosomal protein L5  74.59 
 
 		 187 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000356409  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1027  50S ribosomal protein L5  74.59 
 
 		 187 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000321161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1044  50S ribosomal protein L5  74.59 
 
 		 187 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000979581  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5035  50S ribosomal protein L5  74.19 
 
 		 188 aa  261  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000622365  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04100  LSU ribosomal protein L5P  75.98 
 
 		 189 aa  254  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0594  50S ribosomal protein L5  75.82 
 
 		 199 aa  253  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  66.1 
 
 		 189 aa  247  8e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 183 aa  246  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  64.77 
 
 		 180 aa  246  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 186 aa  245  2e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 180 aa  244  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  64.04 
 
 		 181 aa  244  9e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 180 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 178 aa  242  3e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  62.22 
 
 		 180 aa  242  3e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 178 aa  241  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2166  ribosomal protein L5  64.25 
 
 		 183 aa  241  3.9999999999999997e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0438  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 178 aa  239  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121232  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  57.22 
 
 		 220 aa  238  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  59.89 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  60.56 
 
 		 180 aa  237  9e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 180 aa  237  9e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  58.33 
 
 		 180 aa  235  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  234  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  234  7e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0638  ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000106157  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 191 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4536  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322286  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 180 aa  233  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 182 aa  232  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 193 aa  231  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0335  ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000680284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5067  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000562403  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 185 aa  231  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  231  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 192 aa  231  6e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  58.89 
 
 		 180 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>