More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3889 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3889  50S ribosomal protein L18P  100 
 
 		 127 aa  250  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2672  ribosomal protein L18  67.72 
 
 		 127 aa  177  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2960  50S ribosomal protein L18P  67.72 
 
 		 127 aa  176  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00477287  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29580  LSU ribosomal protein L18P  73.87 
 
 		 123 aa  169  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100392  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  64.57 
 
 		 127 aa  164  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0643  ribosomal protein L18  72.07 
 
 		 123 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258445  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  66.67 
 
 		 128 aa  161  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  65.35 
 
 		 124 aa  160  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0603  ribosomal protein L18  70.27 
 
 		 123 aa  160  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4491  ribosomal protein L18  69.23 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17010  LSU ribosomal protein L18P  70.27 
 
 		 124 aa  158  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000838424  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2643  ribosomal protein L18  76.24 
 
 		 123 aa  157  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20710  LSU ribosomal protein L18P  72.07 
 
 		 124 aa  157  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3401  ribosomal protein L18  67.54 
 
 		 134 aa  156  8e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1139  ribosomal protein L18  66.14 
 
 		 122 aa  156  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  68.81 
 
 		 134 aa  156  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000255511  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  69.44 
 
 		 123 aa  151  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0704  ribosomal protein L18  61.42 
 
 		 127 aa  150  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.815408  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3127  ribosomal protein L18  64.06 
 
 		 125 aa  150  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  61.42 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1201  50S ribosomal protein L18  69.81 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0426216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0947  ribosomal protein L18  62.99 
 
 		 127 aa  147  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0241036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  67.31 
 
 		 134 aa  146  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  62.1 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  64.91 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10734  50S ribosomal protein L18  61.54 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00420212  normal  0.645623 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  64.04 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  67.92 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0578  50S ribosomal protein L18  67.33 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1102  LSU ribosomal protein L18P  63.78 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0571737 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1060  50S ribosomal protein L18  65.69 
 
 		 134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00000172408  normal  0.393686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1031  50S ribosomal protein L18  65.69 
 
 		 134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1048  50S ribosomal protein L18  65.69 
 
 		 134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00198535  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23640  LSU ribosomal protein L18P  63.41 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.429981  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0267  ribosomal protein L18  65.35 
 
 		 123 aa  136  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6598  ribosomal protein L18  65.77 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  63.16 
 
 		 120 aa  130  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  52.89 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  56.03 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  54.33 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  57.02 
 
 		 122 aa  123  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  62 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4299  ribosomal protein L18  70 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.51112  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  62.63 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  55.75 
 
 		 118 aa  121  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  61.76 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1446  50S ribosomal protein L18  56 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267488 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  53.51 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  55.65 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  52.63 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  53.91 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  55.17 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1348  50S ribosomal protein L18  54.4 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000432903  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  53.85 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  53.85 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  53.98 
 
 		 122 aa  116  7.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1002  50S ribosomal protein L18  53.17 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168724  hitchhiker  0.00975315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  55.56 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  52.99 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  50.86 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  54.31 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  54.31 
 
 		 120 aa  115  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  53.85 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3907  ribosomal protein L18  66 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  52.63 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  51.75 
 
 		 124 aa  114  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  52.63 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  49.12 
 
 		 120 aa  114  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  54.31 
 
 		 119 aa  114  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  54.31 
 
 		 119 aa  114  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  52.63 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  51.72 
 
 		 120 aa  113  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 120 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  57.43 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  51.72 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  55.2 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  51.72 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  56.31 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  56.31 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2139  50S ribosomal protein L18P  57 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432612  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  53.51 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  55.2 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  50.43 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  50.88 
 
 		 119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  50.88 
 
 		 119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  47.9 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  56.3 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1857  50S ribosomal protein L18  52 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1835  50S ribosomal protein L18  49.09 
 
 		 119 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1924  50S ribosomal protein L18  62.11 
 
 		 120 aa  110  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0337  50S ribosomal protein L18  62.11 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>