More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3885 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 437 aa  877    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  67.95 
 
 		 438 aa  617  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  69.34 
 
 		 438 aa  603  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  67.73 
 
 		 432 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  65.3 
 
 		 437 aa  589  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  64.48 
 
 		 442 aa  587  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  68.55 
 
 		 435 aa  581  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2668  preprotein translocase subunit SecY  66.06 
 
 		 436 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  64.01 
 
 		 436 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2956  preprotein translocase subunit SecY  64.85 
 
 		 436 aa  571  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  65.47 
 
 		 441 aa  569  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  65.47 
 
 		 441 aa  570  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  62.73 
 
 		 437 aa  567  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  64.07 
 
 		 430 aa  559  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  63.8 
 
 		 430 aa  555  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  63.7 
 
 		 431 aa  555  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  63.7 
 
 		 429 aa  551  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  64.59 
 
 		 448 aa  548  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  62.33 
 
 		 436 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  61.76 
 
 		 439 aa  543  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  60.54 
 
 		 441 aa  542  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  61.31 
 
 		 439 aa  541  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  60.45 
 
 		 441 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  59.78 
 
 		 441 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  60 
 
 		 445 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  60.32 
 
 		 435 aa  541  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  59.78 
 
 		 441 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  59.78 
 
 		 441 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  62.33 
 
 		 432 aa  537  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3123  preprotein translocase, SecY subunit  63.72 
 
 		 436 aa  538  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  60.05 
 
 		 429 aa  529  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23600  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  59.36 
 
 		 434 aa  528  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16970  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  61.68 
 
 		 435 aa  527  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0174147  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  58.26 
 
 		 445 aa  526  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  58.91 
 
 		 457 aa  518  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  59.55 
 
 		 445 aa  518  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  55.56 
 
 		 434 aa  514  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1053  preprotein translocase, SecY subunit  59.29 
 
 		 449 aa  504  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.615544 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0271  preprotein translocase, SecY subunit  53.29 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1727  preprotein translocase subunit SecY  53.9 
 
 		 445 aa  456  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000416171  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  49.66 
 
 		 445 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  47.63 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  50.45 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  50.45 
 
 		 447 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  47.31 
 
 		 420 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  46.7 
 
 		 429 aa  385  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  49.55 
 
 		 447 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  48.32 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  47.54 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0418  preprotein translocase, SecY subunit  45.91 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  46.68 
 
 		 463 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  46.7 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  45.37 
 
 		 437 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  48.07 
 
 		 437 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  46.28 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  46.05 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.66 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  46.62 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  46.43 
 
 		 430 aa  368  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  46.28 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  47.06 
 
 		 422 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  45.82 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  45.78 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  45.6 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  44.39 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  46.19 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1141  preprotein translocase, SecY subunit  45.56 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000440606  normal  0.0147779 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  46.05 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  46.05 
 
 		 421 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  46.01 
 
 		 443 aa  365  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  45.37 
 
 		 435 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  47.44 
 
 		 448 aa  362  5.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2599  preprotein translocase subunit SecY  45.81 
 
 		 440 aa  362  7.0000000000000005e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0785292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  46.52 
 
 		 442 aa  362  7.0000000000000005e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  45.7 
 
 		 444 aa  361  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  44.62 
 
 		 438 aa  361  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  43.56 
 
 		 446 aa  359  5e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  44.67 
 
 		 430 aa  359  6e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  44.82 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  44.7 
 
 		 435 aa  356  5e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  43.18 
 
 		 435 aa  356  5.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  45.37 
 
 		 449 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  45.82 
 
 		 421 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  46.07 
 
 		 419 aa  355  6.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  44.12 
 
 		 419 aa  354  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  46.41 
 
 		 441 aa  354  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  45.72 
 
 		 424 aa  354  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  45.68 
 
 		 443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  43.82 
 
 		 443 aa  353  5e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  45.79 
 
 		 443 aa  352  8e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  45.35 
 
 		 443 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  46.21 
 
 		 441 aa  350  2e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  44.19 
 
 		 443 aa  349  5e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  44.22 
 
 		 443 aa  348  8e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  43.56 
 
 		 419 aa  348  9e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  43.41 
 
 		 448 aa  347  3e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  45.73 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23270  preprotein translocase, SecY subunit  44.62 
 
 		 426 aa  346  5e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.704414  hitchhiker  0.00000750325 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  44.44 
 
 		 443 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  42.99 
 
 		 431 aa  345  6e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>