116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3776 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  729    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  27.47 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  25.92 
 
 		 376 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3777  hypothetical protein  28.34 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  26.89 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  29.19 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  26.72 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  28.48 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.43 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  25.31 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  21.73 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  25.26 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  26.61 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  26.58 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  25.47 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  25.45 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.47 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  27.3 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0187  hypothetical protein  27.17 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  23.26 
 
 		 382 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  25.77 
 
 		 397 aa  57  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  25.3 
 
 		 397 aa  57  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  24.22 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  29.32 
 
 		 856 aa  56.2  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  27.46 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  27.16 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  25.97 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  27.65 
 
 		 845 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  21.72 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  25.6 
 
 		 399 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  26.98 
 
 		 349 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  24.14 
 
 		 378 aa  53.5  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  22.42 
 
 		 388 aa  52.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  24.58 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  25 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  25.3 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  27.35 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  25.87 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  30.43 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  24.86 
 
 		 385 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  23.87 
 
 		 397 aa  50.4  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  22.51 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  22.51 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  29.57 
 
 		 400 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  23.53 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  23.92 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  24.82 
 
 		 847 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  22.09 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  24.63 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  21.08 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  32.02 
 
 		 857 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  27.86 
 
 		 841 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  25.14 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  19.89 
 
 		 380 aa  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  24.71 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  24.32 
 
 		 378 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0870  ABC transporter, permease protein  23.91 
 
 		 400 aa  47  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  23.14 
 
 		 376 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  36.07 
 
 		 845 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  21.77 
 
 		 378 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  27.66 
 
 		 845 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  26.01 
 
 		 859 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  22.14 
 
 		 389 aa  47  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  21.23 
 
 		 407 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  28.07 
 
 		 848 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  23.23 
 
 		 381 aa  46.6  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  24.87 
 
 		 368 aa  46.2  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  23.39 
 
 		 385 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  22.67 
 
 		 392 aa  46.6  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0680  protein of unknown function DUF214  29.26 
 
 		 809 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  26.67 
 
 		 350 aa  46.2  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  22.05 
 
 		 352 aa  46.2  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  26.25 
 
 		 806 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  24.05 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3335  ABC transporter, permease protein  23.93 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.887003  normal  0.0261397 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  24.05 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  24.05 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  24.05 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  22.29 
 
 		 384 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  26.02 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  25.12 
 
 		 406 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3582  protein of unknown function DUF214  27.09 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  21.27 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  21.2 
 
 		 657 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  23.72 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  28.18 
 
 		 852 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0759  hypothetical protein  31.4 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00207585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  25.4 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1813  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.71 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0198484  normal  0.092514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  28.81 
 
 		 863 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  25.24 
 
 		 834 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.35 
 
 		 414 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  22.93 
 
 		 856 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  22.51 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  22.83 
 
 		 654 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  23.18 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  27.37 
 
 		 839 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.11 
 
 		 871 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  23.1 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>