More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3742 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 116 aa  235  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  65.05 
 
 		 127 aa  146  9e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  62 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  61.62 
 
 		 127 aa  133  7.000000000000001e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  70 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  57.84 
 
 		 127 aa  130  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  57 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 136 aa  122  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  61.76 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  61.54 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  57 
 
 		 116 aa  121  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  67.95 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  54.08 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  54.46 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  46.55 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  51 
 
 		 113 aa  110  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  49.5 
 
 		 116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  46.3 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  49.49 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  51.02 
 
 		 123 aa  107  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  55.68 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 127 aa  103  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  60.98 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  55.56 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  50.53 
 
 		 183 aa  100  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.42 
 
 		 115 aa  100  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  51.55 
 
 		 120 aa  100  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  56.04 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 120 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  50.52 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  44.25 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  49.55 
 
 		 122 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  50.51 
 
 		 116 aa  96.7  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  49.02 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  42.98 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 123 aa  93.6  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 		 337 aa  93.2  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.75 
 
 		 105 aa  87.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  70.91 
 
 		 68 aa  84.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  48.1 
 
 		 349 aa  83.6  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  46.67 
 
 		 336 aa  83.6  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  49 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  41.07 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  40.37 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  46.84 
 
 		 347 aa  81.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  40.19 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  41.96 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  49.28 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  39.09 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  52 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 337 aa  77.8  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 130 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  37 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1200  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  44.3 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  40.45 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  37.17 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  31.87 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  36.05 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  36.05 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  36.05 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  36.05 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  43.42 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>