35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3704 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3704  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  700    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0978741  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12810  predicted membrane protein  38.92 
 
 		 396 aa  223  6e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.157231  decreased coverage  0.00366432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6914  hypothetical protein  40.46 
 
 		 359 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  36.49 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0515  hypothetical protein  38.36 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3085  membrane protein-like protein  36.77 
 
 		 373 aa  169  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0361  hypothetical protein  31.79 
 
 		 375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4060  membrane protein-like protein  34.21 
 
 		 367 aa  160  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  35.48 
 
 		 371 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3171  hypothetical protein  33.43 
 
 		 378 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4101  membrane protein-like protein  34.18 
 
 		 369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0201  hypothetical protein  30.52 
 
 		 375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3414  hypothetical protein  34.82 
 
 		 379 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0445  hypothetical protein  30.54 
 
 		 369 aa  139  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.379085 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  36.5 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04990  predicted membrane protein  32.41 
 
 		 365 aa  126  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0274  membrane protein-like protein  28.41 
 
 		 399 aa  123  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.024335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0317  membrane protein-like protein  29.28 
 
 		 425 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0942874  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01600  hypothetical protein  33.33 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3027  membrane protein-like protein  33.23 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25710  predicted membrane protein  28.15 
 
 		 443 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  27.09 
 
 		 431 aa  90.9  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  34.84 
 
 		 355 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  31.58 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000107578  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2712  hypothetical protein  33.09 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.354831 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0385  hypothetical protein  27.91 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0370  hypothetical protein  27.91 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.168954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  30.53 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0479  hypothetical protein  30.47 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  31.39 
 
 		 415 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  27.88 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  25.69 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05220  hypothetical protein  29.17 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07150  predicted membrane protein  28.29 
 
 		 392 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.269027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4888  membrane protein-like protein  26.4 
 
 		 497 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>