More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3697 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  37.1 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  37.64 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1210  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0313613  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 236 aa  94.7  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 236 aa  90.5  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 221 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 194 aa  85.9  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 229 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32400  transcriptional regulator, tetR family  31.68 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8733  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153176  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  30.77 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2148  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2069  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 125 aa  52.4  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 317 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  30.28 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 307 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19560  transcriptional regulator, tetR family  31.5 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3543  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0364286 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 234 aa  51.6  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0836  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>