67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3648 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  750    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  54.96 
 
 
388 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  51.53 
 
 
396 aa  292  7e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  47.3 
 
 
423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  50.75 
 
 
415 aa  280  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  47.77 
 
 
400 aa  278  9e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  43.86 
 
 
411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  46.25 
 
 
400 aa  266  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  43.03 
 
 
414 aa  266  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  45.5 
 
 
428 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  51.04 
 
 
403 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  43.44 
 
 
418 aa  250  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  44.19 
 
 
407 aa  249  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  44.96 
 
 
438 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  43.77 
 
 
422 aa  239  5.999999999999999e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  40.75 
 
 
412 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  48.54 
 
 
428 aa  237  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  39.24 
 
 
392 aa  236  7e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  48.44 
 
 
411 aa  209  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  41.28 
 
 
396 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  35.13 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  37.22 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  41.19 
 
 
443 aa  183  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  40.37 
 
 
383 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  41.79 
 
 
412 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  41.79 
 
 
412 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  41.79 
 
 
369 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  40.23 
 
 
372 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  37.63 
 
 
399 aa  170  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  40.82 
 
 
381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  36.58 
 
 
477 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  39.63 
 
 
382 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  39.63 
 
 
487 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  37.89 
 
 
416 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  39.66 
 
 
358 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  31.34 
 
 
407 aa  137  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  33.01 
 
 
474 aa  123  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  26.95 
 
 
402 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  29.95 
 
 
444 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  27.2 
 
 
401 aa  97.8  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  23.51 
 
 
385 aa  96.7  6e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  27.17 
 
 
420 aa  94.4  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  26.57 
 
 
399 aa  94.4  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  25.81 
 
 
375 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  25.06 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  22.06 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  25.78 
 
 
417 aa  66.2  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  22.01 
 
 
396 aa  62.8  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  26.16 
 
 
394 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  25.21 
 
 
396 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  21.02 
 
 
433 aa  56.2  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  25.47 
 
 
407 aa  56.2  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.3 
 
 
280 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  26.57 
 
 
431 aa  50.8  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  26.72 
 
 
262 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0890  hypothetical protein  36.67 
 
 
227 aa  47  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 
284 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  30.36 
 
 
293 aa  46.2  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0622  ribosomal L11 methyltransferase  40.51 
 
 
289 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1100  ribosomal L11 methyltransferase  43.24 
 
 
289 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.441785 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  31.21 
 
 
234 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 
268 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2162  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.83 
 
 
397 aa  43.9  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.125639  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2376  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  41.1 
 
 
289 aa  43.9  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.06603  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 
269 aa  43.1  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2298  hypothetical protein  31.75 
 
 
212 aa  43.1  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2419  hypothetical protein  31.75 
 
 
212 aa  42.7  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>