More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3470 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3470  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 460 aa  903    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00143451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7289  FolC bifunctional protein  60.93 
 
 		 515 aa  499  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  57.5 
 
 		 470 aa  491  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  60.96 
 
 		 452 aa  489  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1582  FolC bifunctional protein  61.49 
 
 		 447 aa  488  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2190  folylpolyglutamate synthetase  59.73 
 
 		 443 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400499  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1536  FolC bifunctional protein  54.31 
 
 		 471 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00142339  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  59.18 
 
 		 461 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5271  FolC bifunctional protein  59.82 
 
 		 468 aa  448  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2054  FolC bifunctional protein  55.63 
 
 		 508 aa  451  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832058  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  57.01 
 
 		 444 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  56.79 
 
 		 444 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3391  FolC bifunctional protein  56.95 
 
 		 450 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7286  FolC bifunctional protein  57.05 
 
 		 440 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0401599  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23910  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  51.86 
 
 		 466 aa  423  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.290984  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0742  FolC bifunctional protein  57.89 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0127305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09160  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  51.36 
 
 		 464 aa  419  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1496  FolC bifunctional protein  54.65 
 
 		 515 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.038753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  51.95 
 
 		 463 aa  417  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1469  FolC bifunctional protein  54.67 
 
 		 471 aa  417  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0493364  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12473  folylpolyglutamate synthase protein folC  52.3 
 
 		 487 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.669208 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  54.02 
 
 		 468 aa  401  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  51.32 
 
 		 452 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3497  FolC bifunctional protein  54.7 
 
 		 526 aa  401  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2567  FolC bifunctional protein  51.91 
 
 		 477 aa  395  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10060  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  52.19 
 
 		 517 aa  385  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0614785  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3557  FolC bifunctional protein  54.65 
 
 		 467 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.011361  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3562  FolC bifunctional protein  54.87 
 
 		 467 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.523756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3630  FolC bifunctional protein  54.65 
 
 		 467 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.299484 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2631  FolC bifunctional protein  54.87 
 
 		 471 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0121718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2397  FolC bifunctional protein  51.33 
 
 		 452 aa  385  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0236925  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  53.38 
 
 		 448 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3950  FolC bifunctional protein  53.76 
 
 		 471 aa  385  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2472  FolC bifunctional protein  55.37 
 
 		 448 aa  378  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.829093 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09900  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  47.24 
 
 		 462 aa  369  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  43.96 
 
 		 543 aa  340  4e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  44.02 
 
 		 485 aa  339  7e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1208  FolC bifunctional protein  43.32 
 
 		 445 aa  265  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  36.45 
 
 		 440 aa  236  7e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  37.29 
 
 		 434 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  32.55 
 
 		 429 aa  229  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  39.07 
 
 		 424 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  36.8 
 
 		 431 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1209  folylpolyglutamate synthase-like  44.86 
 
 		 476 aa  227  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503356  normal  0.49053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  33.85 
 
 		 459 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.26 
 
 		 466 aa  222  9.999999999999999e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  30.71 
 
 		 443 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  31.99 
 
 		 437 aa  220  5e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  31.99 
 
 		 435 aa  220  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  38.12 
 
 		 424 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  31.84 
 
 		 428 aa  219  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  31.16 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  37.47 
 
 		 424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  31.94 
 
 		 433 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  34.45 
 
 		 429 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  40.46 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.93 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  37.94 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  31.28 
 
 		 433 aa  209  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.68 
 
 		 433 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  31.41 
 
 		 433 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  31.41 
 
 		 433 aa  206  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  31.41 
 
 		 433 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.41 
 
 		 433 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  31.41 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  35.43 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  36.84 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  31.43 
 
 		 424 aa  205  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  28.79 
 
 		 433 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  27.92 
 
 		 413 aa  203  4e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  32.65 
 
 		 431 aa  203  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  35.97 
 
 		 437 aa  203  6e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.83 
 
 		 433 aa  202  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  35.57 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1821  FolC bifunctional protein  38.67 
 
 		 428 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  31.79 
 
 		 435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  27.88 
 
 		 432 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  34.36 
 
 		 437 aa  197  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3755  FolC bifunctional protein  39.39 
 
 		 461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0263882  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  32.01 
 
 		 416 aa  197  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.37 
 
 		 433 aa  196  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  29.69 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  32.2 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  34.82 
 
 		 878 aa  193  6e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  32.04 
 
 		 447 aa  190  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  37.56 
 
 		 381 aa  189  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  35.53 
 
 		 438 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  33.96 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  28.87 
 
 		 441 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  28.64 
 
 		 441 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  32.71 
 
 		 437 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  36.67 
 
 		 421 aa  187  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2653  FolC bifunctional protein  35.03 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  34.94 
 
 		 813 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  32.15 
 
 		 428 aa  182  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  29.82 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  30.4 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  30.82 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  34.18 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0949  FolC bifunctional protein  33.03 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>