127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3421 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  61.26 
 
 		 843 aa  995    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09380  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  58.34 
 
 		 848 aa  965    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  62.48 
 
 		 825 aa  1013    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  100 
 
 		 858 aa  1748    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  44.3 
 
 		 790 aa  672    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  47.17 
 
 		 795 aa  694    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  47.67 
 
 		 795 aa  704    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  46.64 
 
 		 795 aa  685    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  43.47 
 
 		 790 aa  669    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  61.88 
 
 		 834 aa  996    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4269  Kojibiose phosphorylase  45.85 
 
 		 767 aa  632  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0308  Kojibiose phosphorylase  45.17 
 
 		 786 aa  624  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0531  Kojibiose phosphorylase  45.47 
 
 		 781 aa  618  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27210  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  43.57 
 
 		 807 aa  608  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585996  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  38.7 
 
 		 780 aa  588  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  42.26 
 
 		 786 aa  580  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  41.44 
 
 		 800 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  40.66 
 
 		 804 aa  567  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0438  Kojibiose phosphorylase  41.71 
 
 		 791 aa  560  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  37.39 
 
 		 781 aa  561  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6405  Kojibiose phosphorylase  42.02 
 
 		 784 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.338097  normal  0.788674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1073  Kojibiose phosphorylase  41.68 
 
 		 789 aa  553  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2817  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  40.69 
 
 		 810 aa  549  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  44.25 
 
 		 787 aa  550  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0525  Kojibiose phosphorylase  42.36 
 
 		 791 aa  551  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.659551  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  36.53 
 
 		 778 aa  552  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000528962  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2887  family 65 glycoside hydrolase  41.87 
 
 		 824 aa  548  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1809  Kojibiose phosphorylase  42.84 
 
 		 784 aa  548  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2513  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  41.08 
 
 		 786 aa  548  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5750  Kojibiose phosphorylase  41.7 
 
 		 794 aa  538  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.06218  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1472  Kojibiose phosphorylase  40.85 
 
 		 790 aa  535  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1171  glycoside hydrolase family protein  40.33 
 
 		 787 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1188  Kojibiose phosphorylase  40.33 
 
 		 787 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1198  Kojibiose phosphorylase  40.33 
 
 		 787 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51521  normal  0.0335974 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13436  hypothetical protein  39.41 
 
 		 786 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0422368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  35.18 
 
 		 780 aa  511  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  38.88 
 
 		 780 aa  494  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  35.01 
 
 		 788 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  34.05 
 
 		 789 aa  462  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  35.99 
 
 		 778 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0089  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  37.28 
 
 		 777 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472584  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0258  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  37.1 
 
 		 782 aa  431  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  35.42 
 
 		 986 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  30.75 
 
 		 780 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3314  Kojibiose phosphorylase  28.69 
 
 		 805 aa  362  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  30.8 
 
 		 755 aa  347  7e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  29.28 
 
 		 775 aa  344  4e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  29.55 
 
 		 787 aa  340  5e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.52 
 
 		 749 aa  340  5e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0054  maltose phosphorylase  30.53 
 
 		 750 aa  332  2e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000286879  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  29.9 
 
 		 763 aa  330  6e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  29.74 
 
 		 794 aa  330  8e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  29.31 
 
 		 807 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  29.57 
 
 		 789 aa  324  4e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.35 
 
 		 778 aa  323  8e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  28.19 
 
 		 787 aa  323  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  29.28 
 
 		 755 aa  323  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  29.28 
 
 		 755 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0216  maltose phosphorylase  30.52 
 
 		 758 aa  322  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000286832  hitchhiker  0.00000374663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  30.41 
 
 		 757 aa  322  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  29.28 
 
 		 755 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  29.59 
 
 		 965 aa  321  5e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  29.68 
 
 		 755 aa  320  7.999999999999999e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  29.62 
 
 		 748 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  28.94 
 
 		 755 aa  317  6e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  28.82 
 
 		 755 aa  316  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  28.82 
 
 		 755 aa  316  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  28.57 
 
 		 755 aa  315  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.31 
 
 		 759 aa  314  3.9999999999999997e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  29.04 
 
 		 978 aa  313  6.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  28.46 
 
 		 781 aa  313  1e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  26.75 
 
 		 767 aa  312  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  30.59 
 
 		 720 aa  312  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  0.00000128676 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0190  maltose phosphorylase  28.37 
 
 		 765 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1847  maltose phosphorylase  29.92 
 
 		 751 aa  310  1.0000000000000001e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  30.08 
 
 		 774 aa  307  7e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  26.45 
 
 		 768 aa  305  3.0000000000000004e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  27.47 
 
 		 759 aa  298  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.16 
 
 		 762 aa  298  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  28.95 
 
 		 761 aa  293  8e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  28.84 
 
 		 771 aa  293  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0839  maltose phosphorylase  28.27 
 
 		 710 aa  291  3e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0771265  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  36.03 
 
 		 760 aa  291  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  29.63 
 
 		 752 aa  289  1e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  28.82 
 
 		 761 aa  290  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  26.6 
 
 		 769 aa  282  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.91 
 
 		 1051 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0894  maltose phosphorylase  27.55 
 
 		 752 aa  266  1e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  34.23 
 
 		 777 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  27.64 
 
 		 1053 aa  254  5.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  25.61 
 
 		 753 aa  251  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.83 
 
 		 1050 aa  242  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.79 
 
 		 1053 aa  239  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.51 
 
 		 1052 aa  239  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  25.61 
 
 		 1314 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1109  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.11 
 
 		 788 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.824966  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  28.06 
 
 		 776 aa  235  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0346  trehalose 6-phosphate phosphorylase  28.05 
 
 		 807 aa  233  8.000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0553991  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.63 
 
 		 1051 aa  233  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  28.41 
 
 		 1327 aa  227  7e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>