More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3405 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  100 
 
 		 371 aa  714    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  41.58 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  41.53 
 
 		 375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  41.43 
 
 		 349 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  44.39 
 
 		 395 aa  206  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  39.73 
 
 		 404 aa  206  5e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  43.16 
 
 		 372 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  38.83 
 
 		 374 aa  202  9e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  42.02 
 
 		 385 aa  202  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  38.64 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  39.83 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  40.11 
 
 		 391 aa  187  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  42.82 
 
 		 368 aa  186  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  37.37 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  42.27 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  42.31 
 
 		 398 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  39.55 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  39.83 
 
 		 393 aa  180  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  38.81 
 
 		 342 aa  175  9e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  36.22 
 
 		 440 aa  170  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  39.21 
 
 		 392 aa  169  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  35.19 
 
 		 454 aa  169  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  35.96 
 
 		 411 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  38.52 
 
 		 401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2781  glycine oxidase ThiO  36.6 
 
 		 450 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207412  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  37.03 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  38.89 
 
 		 338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  37.9 
 
 		 340 aa  152  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  38.44 
 
 		 410 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  36.54 
 
 		 373 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  33.24 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  37.42 
 
 		 402 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  37.02 
 
 		 360 aa  145  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  35.76 
 
 		 335 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  35.9 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  35.9 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  35.9 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  34.92 
 
 		 376 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  34.77 
 
 		 406 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  32.97 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  34.88 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  38.92 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  28.36 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07960  glycine oxidase ThiO  34.35 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0404626  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  31.75 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  28.45 
 
 		 369 aa  124  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  31.94 
 
 		 371 aa  123  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  28.17 
 
 		 369 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  33.6 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  27.67 
 
 		 369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  35.01 
 
 		 376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  29.07 
 
 		 1033 aa  119  7e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  33.05 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  33.14 
 
 		 324 aa  119  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  32.88 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  29.55 
 
 		 666 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  25.33 
 
 		 372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  34.48 
 
 		 376 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  26.5 
 
 		 369 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  26.5 
 
 		 369 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  27.86 
 
 		 340 aa  115  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  27.86 
 
 		 340 aa  115  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  26.5 
 
 		 369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  26.5 
 
 		 369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  27.43 
 
 		 369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  30.29 
 
 		 652 aa  112  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  26.23 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  27.32 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  30.38 
 
 		 652 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  28.98 
 
 		 666 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.59 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  26.76 
 
 		 369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  32.05 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  24.37 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2431  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.779457 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.72 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3428  glycine oxidase ThiO  30.57 
 
 		 369 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  28.93 
 
 		 377 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0570  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  32.16 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  28.82 
 
 		 360 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3068  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186757  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0520  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0147  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 350 aa  104  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 378 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  27.64 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0537  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 		 369 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1958  glycine oxidase ThiO  30.57 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  32.98 
 
 		 375 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1786  FAD dependent oxidoreductase  29.94 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0563944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  32.18 
 
 		 331 aa  103  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1609  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO, putative  30.55 
 
 		 360 aa  103  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  28.82 
 
 		 367 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>