163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3349 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  100 
 
 		 207 aa  408  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  42.92 
 
 		 224 aa  141  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  44.71 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  42.08 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  43.56 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  44.66 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  44.62 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  42.27 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  42.27 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  42.27 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  38.42 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  37.5 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  36.46 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  38.62 
 
 		 197 aa  101  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  41.4 
 
 		 210 aa  98.2  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  38.98 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  35.54 
 
 		 180 aa  92.4  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  36.75 
 
 		 179 aa  92.8  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  36.93 
 
 		 184 aa  92  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  36.76 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2319  BioY protein  40.98 
 
 		 194 aa  85.9  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1540  BioY protein  40.98 
 
 		 194 aa  85.1  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  40.31 
 
 		 189 aa  84.7  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  45.1 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  40.74 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5454  BioY protein  35.85 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0263826  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  36.41 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  37.99 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  35.14 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  38.55 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  40.88 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  29.83 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  31.69 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  39.09 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  31.15 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  29.83 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  45.16 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  35.62 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  29.83 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  36.36 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  38.78 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2314  hypothetical protein  41.09 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.462217  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  31.58 
 
 		 184 aa  74.7  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  32.04 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  35.59 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  41.59 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  29.79 
 
 		 184 aa  72  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  29.79 
 
 		 184 aa  72  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  35.16 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  35.4 
 
 		 187 aa  72  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  33.33 
 
 		 187 aa  72  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  42.31 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  31.25 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  30.54 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  51.25 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  33.11 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  31.98 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3386  BioY protein  36.98 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.812512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  30.94 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0886  BioY protein  48.15 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.452064  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  33.87 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  34.87 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20560  hypothetical protein  32.69 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  29.28 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  29.28 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  29.28 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  39.74 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  31.21 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  32.81 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  38.12 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  31.94 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  33.53 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  55.56 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  32.3 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  35.56 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3071  BioY protein  37.18 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  29.83 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  33.87 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  29.83 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  34.55 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  34.55 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  28.5 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  28.5 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  36.3 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  34.13 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  29.02 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  27.32 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  35.2 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  28.5 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  28.5 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  28.5 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  29.02 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  34.74 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01740  hypothetical protein  39.88 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  30.22 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  28.72 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2173  hypothetical protein  37.5 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  29.41 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  37.14 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  33.96 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>