More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3347 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 193 aa  383  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  46.15 
 
 		 197 aa  156  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  45.6 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  45.36 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  42.02 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  44.74 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  41.11 
 
 		 206 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  40.53 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  39.89 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  34.03 
 
 		 200 aa  117  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  36.17 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  34.04 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  37.77 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  36.47 
 
 		 183 aa  102  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  37.87 
 
 		 183 aa  99  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  36.22 
 
 		 183 aa  97.8  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  36.22 
 
 		 183 aa  97.8  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  36.22 
 
 		 183 aa  97.8  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  34.32 
 
 		 186 aa  90.9  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  32.96 
 
 		 449 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  32.43 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  35.57 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  32.56 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  27.13 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  26.56 
 
 		 567 aa  72.4  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  31.77 
 
 		 332 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  24.23 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  34.18 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  28.65 
 
 		 489 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  27.75 
 
 		 600 aa  69.3  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  29.59 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  26.23 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  31.75 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  27.75 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  29.68 
 
 		 710 aa  68.2  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  31.09 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  26.73 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0192  pentapeptide repeat-containing protein  37.89 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493873  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  27.95 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  26.11 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  27.95 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  31.09 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  32.9 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  26.59 
 
 		 706 aa  66.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  31.61 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  31.21 
 
 		 872 aa  65.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 		 311 aa  65.5  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  41.44 
 
 		 1033 aa  65.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  24.14 
 
 		 517 aa  65.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  31.64 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  31.55 
 
 		 866 aa  65.1  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  31.64 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  30.16 
 
 		 446 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  31.79 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  29.76 
 
 		 363 aa  64.3  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  28.4 
 
 		 278 aa  64.7  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  26.99 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  28.96 
 
 		 870 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  30.81 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  28.43 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  26.53 
 
 		 521 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  24.88 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  26.98 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1438  pentapeptide repeat protein  25.69 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0273991  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  27.96 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  24.48 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  27.74 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2386  hypothetical protein  26.34 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.193618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 483 aa  62.4  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  43.3 
 
 		 292 aa  62  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  34.71 
 
 		 299 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  26.09 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0445  hypothetical protein  29.9 
 
 		 239 aa  62  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  27.47 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  25.79 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  31.61 
 
 		 452 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  31.69 
 
 		 250 aa  62  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  26.54 
 
 		 351 aa  61.6  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  26.09 
 
 		 401 aa  61.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  26.09 
 
 		 401 aa  61.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  27.49 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  27.75 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  36.21 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  30 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  28.8 
 
 		 485 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  27.49 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  30 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  28.17 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  32.14 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  31.65 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  29.83 
 
 		 727 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  31.58 
 
 		 453 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 		 1191 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  28.57 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  32.28 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  35.45 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  26.98 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  29.5 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  28.77 
 
 		 392 aa  59.3  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>