More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3322 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
338 aa  690    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1193  alcohol dehydrogenase  39.23 
 
 
344 aa  238  1e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  41.28 
 
 
342 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.63 
 
 
337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  40.06 
 
 
341 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  38.62 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  39.45 
 
 
344 aa  213  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.16 
 
 
341 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.16 
 
 
341 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 
342 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  38.63 
 
 
336 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  38.86 
 
 
357 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  38.53 
 
 
341 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.86 
 
 
341 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.86 
 
 
341 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.86 
 
 
341 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  37 
 
 
347 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.55 
 
 
341 aa  209  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.85 
 
 
335 aa  209  6e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  37.72 
 
 
342 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.72 
 
 
342 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  37.72 
 
 
342 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  38.65 
 
 
343 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.84 
 
 
341 aa  206  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.14 
 
 
336 aa  206  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  38.96 
 
 
342 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  38.94 
 
 
343 aa  204  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  38.23 
 
 
341 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.92 
 
 
342 aa  203  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2709  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  37.06 
 
 
334 aa  202  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.04 
 
 
343 aa  202  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 
341 aa  202  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  37.35 
 
 
342 aa  202  9e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.3 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1192  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  36.87 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
342 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.42 
 
 
342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  36.47 
 
 
344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  38.04 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  38.62 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0829  alcohol dehydrogenase  35.1 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.7 
 
 
341 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.13 
 
 
336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  38.17 
 
 
340 aa  196  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  36.78 
 
 
344 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3073  alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 
333 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.06 
 
 
344 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.92 
 
 
342 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0233433  decreased coverage  0.000000000133046 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.06 
 
 
344 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37 
 
 
336 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0303  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  33.33 
 
 
332 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  37.27 
 
 
344 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  38.34 
 
 
344 aa  193  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.85 
 
 
340 aa  193  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.2 
 
 
342 aa  193  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
337 aa  192  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  34.73 
 
 
341 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  38.23 
 
 
342 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1124  alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
338 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 
344 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1096  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.36 
 
 
338 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1113  alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
338 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3343  alcohol dehydrogenase  36.28 
 
 
332 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0866379 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1330  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  34.21 
 
 
380 aa  188  1e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0138  alcohol dehydrogenase  35.06 
 
 
337 aa  186  7e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0343  alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 
333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.23 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2303  alcohol dehydrogenase  37.95 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0264  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.31 
 
 
332 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1937  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.01 
 
 
344 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2022  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  36.33 
 
 
332 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000478739  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.65 
 
 
368 aa  179  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
348 aa  178  9e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6571  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  32.14 
 
 
358 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2413  hypothetical protein  33.63 
 
 
328 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1805  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  35.38 
 
 
332 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6148  alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 
343 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6441  alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 
343 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3732  alcohol dehydrogenase  36.89 
 
 
336 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.564534  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5179  alcohol dehydrogenase  36.47 
 
 
348 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1375  alcohol dehydrogenase  35.86 
 
 
342 aa  176  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5668  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.78 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3003  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  33.64 
 
 
347 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30246  predicted protein  33.33 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0931  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.78 
 
 
339 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2558  hypothetical protein  32.84 
 
 
328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.8 
 
 
347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  34.36 
 
 
332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00520029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  33.92 
 
 
338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  35.98 
 
 
323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2723  alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 
338 aa  173  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0619136  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1844  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.27 
 
 
328 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.364019  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.04 
 
 
351 aa  172  9e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0630  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  30.57 
 
 
344 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0046  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  34.21 
 
 
336 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173418  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1066  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.17 
 
 
339 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743833  normal  0.0804762 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  34.06 
 
 
348 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>