More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3291 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 373 aa  743    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  63.81 
 
 		 386 aa  425  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  58.98 
 
 		 369 aa  411  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  58.06 
 
 		 377 aa  402  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2514  D-alanyl-alanine synthetase A  58.65 
 
 		 382 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.94876  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  58.02 
 
 		 371 aa  398  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2251  D-alanyl-alanine synthetase A  57.03 
 
 		 382 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000796375 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  55.14 
 
 		 376 aa  393  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  57.68 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  58.09 
 
 		 376 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  57.3 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  56.63 
 
 		 394 aa  388  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  55.76 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  55.08 
 
 		 368 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  54.69 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0192  D-alanine/D-alanine ligase  54.23 
 
 		 374 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2310  D-alanine/D-alanine ligase  59.3 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  hitchhiker  0.00305681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1130  D-alanyl-alanine synthetase A  56 
 
 		 367 aa  368  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1680  D-alanine/D-alanine ligase  54.47 
 
 		 389 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344983  hitchhiker  0.00583012 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  51.92 
 
 		 383 aa  363  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  52.69 
 
 		 365 aa  358  7e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  53.35 
 
 		 371 aa  353  4e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  53.35 
 
 		 371 aa  353  4e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  54.35 
 
 		 371 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  53.97 
 
 		 384 aa  350  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  54.03 
 
 		 367 aa  349  5e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  53.23 
 
 		 367 aa  348  6e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  53.49 
 
 		 355 aa  347  3e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08790  D-alanine--D-alanine ligase  52.29 
 
 		 379 aa  338  7e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0347411  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  51.75 
 
 		 373 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1485  D-alanine/D-alanine ligase  51.44 
 
 		 367 aa  333  4e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.209909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2841  D-alanine/D-alanine ligase  52.82 
 
 		 362 aa  319  5e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4988  D-alanine/D-alanine ligase  47.84 
 
 		 364 aa  316  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467567  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  44.68 
 
 		 393 aa  309  5.9999999999999995e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1112  D-alanyl-alanine synthetase A  44.58 
 
 		 395 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  45.03 
 
 		 366 aa  305  7e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18500  D-alanine--D-alanine ligase  48.54 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  47.99 
 
 		 383 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  45.79 
 
 		 376 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  44.9 
 
 		 366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1233  D-ala D-ala ligase N-terminal domain protein  44.09 
 
 		 380 aa  301  9e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148623 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  44.63 
 
 		 364 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  43.37 
 
 		 367 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5376  D-alanine/D-alanine ligase  47.93 
 
 		 350 aa  293  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  46.77 
 
 		 370 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  42.86 
 
 		 362 aa  286  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  42.59 
 
 		 364 aa  285  8e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  43.87 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  41.92 
 
 		 365 aa  281  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  42.23 
 
 		 364 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  41.96 
 
 		 364 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  41.96 
 
 		 364 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  41.96 
 
 		 364 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  42.19 
 
 		 364 aa  278  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  46.51 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  43.99 
 
 		 369 aa  277  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  40.11 
 
 		 366 aa  276  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  41.27 
 
 		 359 aa  276  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  40.92 
 
 		 364 aa  276  6e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  44.69 
 
 		 361 aa  275  8e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5374  D-alanyl-alanine synthetase A  44.59 
 
 		 367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896032 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  42.98 
 
 		 361 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  41.21 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  41.21 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  41.21 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  41.21 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  41.21 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  41.21 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2952  D-alanine--D-alanine ligase  47.79 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  41.21 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  41.21 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  41.35 
 
 		 363 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  42.16 
 
 		 363 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  40.33 
 
 		 375 aa  271  2e-71  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  40.81 
 
 		 376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  41.6 
 
 		 356 aa  269  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  41.6 
 
 		 356 aa  269  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  41.76 
 
 		 357 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  41.8 
 
 		 362 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  42.82 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  42.31 
 
 		 353 aa  267  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  42.51 
 
 		 360 aa  266  4e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  45.21 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  45.74 
 
 		 358 aa  266  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  41.19 
 
 		 358 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  41.51 
 
 		 367 aa  262  6.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  41.19 
 
 		 351 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  40.59 
 
 		 368 aa  261  2e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  39.3 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  40.16 
 
 		 362 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  39.3 
 
 		 361 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  39.02 
 
 		 361 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  39.02 
 
 		 361 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  41.19 
 
 		 351 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  39.02 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0922  D-alanyl-alanine synthetase A  44.35 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  46.96 
 
 		 362 aa  256  5e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  42.7 
 
 		 352 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  39.34 
 
 		 343 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  40.37 
 
 		 363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>