More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3281 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  100 
 
 
276 aa  549  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  71.98 
 
 
240 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  64.84 
 
 
246 aa  279  4e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  64.85 
 
 
268 aa  273  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1177  ribonuclease III  67.63 
 
 
252 aa  271  6e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312769  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  66.67 
 
 
248 aa  271  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  68.12 
 
 
252 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  66.51 
 
 
249 aa  266  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1139  ribonuclease III  64.88 
 
 
306 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323858  normal  0.0251289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  64.39 
 
 
276 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  65.7 
 
 
267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3601  ribonuclease III  66.3 
 
 
270 aa  249  5e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  62.91 
 
 
243 aa  248  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2072  ribonuclease III  56.81 
 
 
262 aa  248  6e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  61.65 
 
 
252 aa  244  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  59.47 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1567  ribonuclease III  60.47 
 
 
249 aa  241  7.999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0292107  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  59.71 
 
 
234 aa  240  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7995  Ribonuclease III  67.45 
 
 
243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1376  Ribonuclease III  63.73 
 
 
224 aa  238  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028132  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12940  ribonuclease III  61.73 
 
 
240 aa  237  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4029  ribonuclease III  63.16 
 
 
270 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  57.08 
 
 
234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  61.14 
 
 
239 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1929  ribonuclease III  59.02 
 
 
234 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1949  ribonuclease III  59.02 
 
 
234 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1995  ribonuclease III  59.02 
 
 
234 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814275  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2171  ribonuclease III  58.69 
 
 
235 aa  229  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2501  ribonuclease III  57.65 
 
 
240 aa  229  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5964  ribonuclease III  57.54 
 
 
267 aa  227  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2239  Ribonuclease III  55.24 
 
 
242 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000641726 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  53.92 
 
 
241 aa  222  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  55.29 
 
 
220 aa  218  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10860  RNAse III  57.92 
 
 
228 aa  218  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0129939  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09490  RNAse III  61.97 
 
 
250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.162457 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  52.34 
 
 
250 aa  192  7e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  46.85 
 
 
235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  41.59 
 
 
236 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1041  ribonuclease III  46.38 
 
 
242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.834225  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0336  ribonuclease III  46.15 
 
 
242 aa  177  2e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  45.7 
 
 
232 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  44.6 
 
 
236 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  41.59 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  45.5 
 
 
262 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  40.77 
 
 
245 aa  171  1e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  44.4 
 
 
235 aa  169  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  42.11 
 
 
259 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  44.44 
 
 
236 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  43.42 
 
 
242 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  44.76 
 
 
246 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  44.05 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  47.09 
 
 
233 aa  166  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  44.08 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  40.62 
 
 
246 aa  162  6e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  41.55 
 
 
231 aa  162  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  44.04 
 
 
246 aa  162  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  46.97 
 
 
282 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  43.05 
 
 
377 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  39.83 
 
 
246 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  40.97 
 
 
246 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  42.53 
 
 
246 aa  158  9e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  37.39 
 
 
248 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  44.09 
 
 
221 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  47.8 
 
 
228 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  42.13 
 
 
235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  42.08 
 
 
246 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  37.02 
 
 
248 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  42.38 
 
 
234 aa  155  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  39.29 
 
 
253 aa  155  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  37.02 
 
 
237 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  42.93 
 
 
221 aa  154  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  42.79 
 
 
385 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  38.94 
 
 
241 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  38.16 
 
 
233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  38.94 
 
 
241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  42.34 
 
 
383 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  39.55 
 
 
243 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  39.55 
 
 
243 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  42.34 
 
 
383 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  40.09 
 
 
241 aa  151  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  42.15 
 
 
260 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  40.54 
 
 
236 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  40.74 
 
 
225 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  40.74 
 
 
225 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  39.25 
 
 
238 aa  149  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  39.23 
 
 
222 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  39.65 
 
 
230 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  41.47 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  38.26 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  43.37 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  42.4 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  37.1 
 
 
245 aa  146  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  39.29 
 
 
224 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  37.99 
 
 
240 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  36.49 
 
 
229 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  38.84 
 
 
225 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  44.66 
 
 
232 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  39.56 
 
 
227 aa  145  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  37.74 
 
 
223 aa  144  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  41.85 
 
 
230 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>